162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0735 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0735  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
512 aa  1058    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  39.46 
 
 
1171 aa  163  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.25 
 
 
1629 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  38.17 
 
 
1301 aa  136  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1126 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
776 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
1224 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
653 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3033  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.95 
 
 
777 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1135 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1042  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.71 
 
 
1059 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.192885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  33.85 
 
 
906 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
770 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
770 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.21 
 
 
1560 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
1354 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.18 
 
 
651 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
773 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
783 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.09 
 
 
1114 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1511  hypothetical protein  36.18 
 
 
258 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 
812 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  27.59 
 
 
440 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
604 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
1032 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
530 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  24.62 
 
 
553 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
657 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
1325 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.27 
 
 
564 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0022  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.24 
 
 
1499 aa  97.8  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 
389 aa  97.8  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  24.04 
 
 
537 aa  97.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.27 
 
 
637 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
741 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.22 
 
 
823 aa  92.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.348272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.88 
 
 
1051 aa  91.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.48 
 
 
869 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
546 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.11 
 
 
1225 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.65 
 
 
1466 aa  87.8  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  27.14 
 
 
1081 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1087 aa  87.4  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.88 
 
 
869 aa  87  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  27.49 
 
 
1346 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0458  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.91 
 
 
1037 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
896 aa  84  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
656 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  26.5 
 
 
896 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3932  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.75 
 
 
1135 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 
1352 aa  80.5  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  29.65 
 
 
787 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4344  PAS:GGDEF  32.1 
 
 
707 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
1021 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.17 
 
 
1306 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.06 
 
 
989 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.67 
 
 
1017 aa  77  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0011  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.03 
 
 
952 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  26.37 
 
 
982 aa  73.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
544 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1261 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  26.26 
 
 
980 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
781 aa  70.5  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  23.15 
 
 
1589 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0805  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  26.07 
 
 
706 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.22 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 
1059 aa  68.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  25.14 
 
 
1057 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  24.86 
 
 
952 aa  67.4  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.26 
 
 
879 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  23.86 
 
 
781 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  22.86 
 
 
919 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.9 
 
 
817 aa  63.9  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0389  histidine kinase  32.76 
 
 
557 aa  63.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0139  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
348 aa  63.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000378596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 
814 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.2 
 
 
688 aa  62  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  22.89 
 
 
728 aa  61.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
765 aa  61.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2664  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.27 
 
 
874 aa  61.6  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  23.04 
 
 
703 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2935  putative GAF sensor protein  23.3 
 
 
242 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000271944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.46 
 
 
905 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  25.52 
 
 
359 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1121  diguanylate cyclase  29.41 
 
 
305 aa  60.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.323017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  23.56 
 
 
1335 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0208  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.79 
 
 
947 aa  60.5  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.2 
 
 
572 aa  60.1  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  27.78 
 
 
771 aa  60.1  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  25.28 
 
 
1216 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  23.44 
 
 
843 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3581  GGDEF domain-containing protein  26.67 
 
 
312 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0819  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.81 
 
 
793 aa  58.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00766455  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2586  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  23.39 
 
 
1365 aa  58.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3057  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  25.93 
 
 
841 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
683 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  25.26 
 
 
1061 aa  57  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3626  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.87 
 
 
840 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>