More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0624 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 808 aa  1648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  32.25 
 
 		 664 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  27.75 
 
 		 760 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  33.6 
 
 		 682 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  27.21 
 
 		 757 aa  131  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  27.87 
 
 		 804 aa  128  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  31.19 
 
 		 686 aa  127  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  29.78 
 
 		 649 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  31.18 
 
 		 774 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  31.18 
 
 		 774 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  31.96 
 
 		 592 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  27.25 
 
 		 680 aa  122  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  30.9 
 
 		 776 aa  122  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  28.43 
 
 		 654 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  26.12 
 
 		 691 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.98 
 
 		 672 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  28.4 
 
 		 712 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  29.18 
 
 		 798 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  26.5 
 
 		 723 aa  116  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  28.29 
 
 		 653 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  25.42 
 
 		 691 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 663 aa  114  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  29.49 
 
 		 660 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  28.71 
 
 		 677 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  31.68 
 
 		 750 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  32.42 
 
 		 590 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  25.28 
 
 		 747 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  31.68 
 
 		 750 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  41.14 
 
 		 657 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  27.23 
 
 		 680 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  28.68 
 
 		 788 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  41.14 
 
 		 657 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  31.75 
 
 		 679 aa  111  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.94 
 
 		 673 aa  110  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  32.7 
 
 		 750 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  29.43 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  31.18 
 
 		 709 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  26.73 
 
 		 685 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  29.43 
 
 		 657 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  29.24 
 
 		 649 aa  108  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  32.42 
 
 		 647 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 659 aa  108  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  40.13 
 
 		 660 aa  107  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 649 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.45 
 
 		 652 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  29.64 
 
 		 677 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  28.81 
 
 		 716 aa  107  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  42.21 
 
 		 678 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  41.22 
 
 		 650 aa  106  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  28.83 
 
 		 641 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  41.25 
 
 		 690 aa  106  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  29.43 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  30.9 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  30.4 
 
 		 608 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  30.66 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  27.02 
 
 		 747 aa  105  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  31.66 
 
 		 748 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  33.52 
 
 		 588 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 663 aa  105  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.54 
 
 		 661 aa  104  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 693 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.61 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  42.07 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  25.37 
 
 		 749 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  39.55 
 
 		 721 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  30.16 
 
 		 686 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  24.81 
 
 		 768 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  32.27 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  28.11 
 
 		 655 aa  103  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  36.17 
 
 		 643 aa  103  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  36.17 
 
 		 643 aa  102  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  28.28 
 
 		 716 aa  102  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  26.38 
 
 		 756 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 		 719 aa  101  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  40 
 
 		 654 aa  101  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  28.52 
 
 		 643 aa  101  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 653 aa  100  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.15 
 
 		 638 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  40.14 
 
 		 669 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  26.09 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  30.9 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  45.53 
 
 		 641 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 707 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  42.28 
 
 		 645 aa  99.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 		 643 aa  99  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  44.72 
 
 		 644 aa  98.6  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  29.51 
 
 		 645 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 645 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  29.51 
 
 		 645 aa  98.6  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 645 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 645 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 645 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 645 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  41.46 
 
 		 645 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  39.71 
 
 		 698 aa  98.2  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  29.51 
 
 		 645 aa  98.6  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 645 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>