More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1905 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 713 aa  1465    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 720 aa  346  8e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  33.64 
 
 		 720 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 720 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 720 aa  333  8e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.36 
 
 		 750 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 773 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 719 aa  129  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 760 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 748 aa  125  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 763 aa  124  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  26.59 
 
 		 700 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  21.96 
 
 		 745 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  21.82 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  25.68 
 
 		 691 aa  103  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  23.31 
 
 		 687 aa  103  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 668 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 751 aa  99.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  31.34 
 
 		 848 aa  97.4  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  22.77 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 733 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  34.29 
 
 		 833 aa  90.5  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 772 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 661 aa  88.6  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 662 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 653 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 649 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 734 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 679 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 778 aa  75.5  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  21.06 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  21.11 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1128 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  22.68 
 
 		 668 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  22.37 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.75 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.6 
 
 		 633 aa  72  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  27.64 
 
 		 618 aa  72  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.71 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  21.69 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 627 aa  70.9  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 617 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  21.86 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  26.99 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  23.81 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.37 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 653 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.97 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 736 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 699 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 751 aa  65.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 698 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.24 
 
 		 1023 aa  65.1  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 792 aa  64.7  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  26.26 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  24.83 
 
 		 677 aa  63.9  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 697 aa  63.9  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.04 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 721 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  26.36 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.44 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 676 aa  62  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  24.26 
 
 		 746 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  24.56 
 
 		 746 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 869 aa  61.6  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  23.53 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  22.5 
 
 		 746 aa  61.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 861 aa  61.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 737 aa  61.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.32 
 
 		 663 aa  60.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 861 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 861 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  20.25 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.8 
 
 		 653 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 659 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 634 aa  59.7  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 655 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>