More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1906 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  69.33 
 
 
609 aa  801    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  100 
 
 
749 aa  1544    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  66.61 
 
 
791 aa  858    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  74.21 
 
 
682 aa  1058    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  52.56 
 
 
654 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  51.64 
 
 
797 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  47.89 
 
 
547 aa  506  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  44.81 
 
 
549 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  46.22 
 
 
549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  47.18 
 
 
545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  44.32 
 
 
542 aa  463  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  47.26 
 
 
628 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  44.07 
 
 
640 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  44.25 
 
 
591 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  43.53 
 
 
558 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  49.41 
 
 
1255 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  40.26 
 
 
831 aa  426  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  41.73 
 
 
1335 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  41.87 
 
 
1319 aa  428  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
551 aa  426  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  48.26 
 
 
847 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  39.31 
 
 
722 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  40.91 
 
 
770 aa  385  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  42.79 
 
 
692 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.61 
 
 
583 aa  376  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  43.73 
 
 
612 aa  335  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  36.86 
 
 
510 aa  334  3e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
991 aa  323  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  37.07 
 
 
519 aa  321  3.9999999999999996e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  37.6 
 
 
671 aa  317  6e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  39.14 
 
 
604 aa  293  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  38.39 
 
 
513 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  38.64 
 
 
617 aa  286  7e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.04 
 
 
618 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  34.97 
 
 
512 aa  282  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
547 aa  281  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  35.31 
 
 
543 aa  274  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  38.44 
 
 
620 aa  273  9e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
546 aa  272  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  34.88 
 
 
546 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  33 
 
 
549 aa  271  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38.32 
 
 
622 aa  271  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
546 aa  269  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
546 aa  269  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
557 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  37.7 
 
 
610 aa  263  8e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  32.67 
 
 
557 aa  261  5.0000000000000005e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.02 
 
 
492 aa  258  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
492 aa  254  3e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.05 
 
 
491 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  30.36 
 
 
557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.04 
 
 
489 aa  244  6e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  31.64 
 
 
559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
557 aa  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
544 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  29.31 
 
 
577 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  29.84 
 
 
572 aa  222  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  33.77 
 
 
548 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  32.96 
 
 
552 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  29.87 
 
 
552 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.93 
 
 
476 aa  187  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
311 aa  185  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  29.61 
 
 
515 aa  177  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  29.9 
 
 
445 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  29.5 
 
 
423 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  30.08 
 
 
485 aa  168  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  29.73 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  28.72 
 
 
474 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  27.9 
 
 
489 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  28.33 
 
 
490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  27.04 
 
 
491 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  28.37 
 
 
488 aa  164  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.75 
 
 
449 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  27.85 
 
 
442 aa  164  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  32.01 
 
 
430 aa  163  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  29.82 
 
 
479 aa  163  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
467 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  31.7 
 
 
445 aa  163  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
484 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.63 
 
 
453 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  29.18 
 
 
521 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.11 
 
 
483 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  27.92 
 
 
482 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  29.84 
 
 
433 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  27.69 
 
 
491 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  29.72 
 
 
467 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
480 aa  162  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  29.69 
 
 
464 aa  162  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
485 aa  162  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
482 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  28.87 
 
 
508 aa  161  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
482 aa  160  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  28.1 
 
 
488 aa  160  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
482 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>