152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2295 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  95.51 
 
 
402 aa  725    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
402 aa  779    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  36.93 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  36.02 
 
 
432 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
402 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
408 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  34 
 
 
402 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  35.24 
 
 
402 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
415 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  32.04 
 
 
425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  30.75 
 
 
417 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  28.37 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  31.92 
 
 
399 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  31.09 
 
 
389 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  30.89 
 
 
387 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  31.09 
 
 
387 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  30 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  31.5 
 
 
397 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
433 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  31.18 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  33.24 
 
 
393 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  28.65 
 
 
408 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
414 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  29.79 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
426 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  31.43 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  30.98 
 
 
416 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  30.98 
 
 
416 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  27.98 
 
 
415 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
422 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  29.46 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  31.34 
 
 
397 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  31.02 
 
 
401 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.7 
 
 
369 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  27.81 
 
 
411 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
416 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  32.56 
 
 
387 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
399 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  29.53 
 
 
395 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  32.01 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  34.52 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  28.85 
 
 
390 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  27.93 
 
 
416 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  30.64 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  25.66 
 
 
414 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  27.12 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  26.76 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  28.65 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  24.57 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  23.62 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.21 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  24.11 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  29.75 
 
 
216 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  25.96 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  25.77 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  25.68 
 
 
434 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  26.69 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
437 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.03 
 
 
435 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
405 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 
442 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.04 
 
 
435 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
408 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.62 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  23.77 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  23.74 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  27.74 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23.56 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  23.03 
 
 
457 aa  53.5  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 
409 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  23.51 
 
 
430 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  25.22 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  24.7 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  23.99 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
409 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
420 aa  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.93 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 
413 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  26.1 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  24.65 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
405 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  23.56 
 
 
427 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.04 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  25.98 
 
 
427 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>