155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1093 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  41.85 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  40.4 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  40.2 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  41.88 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  38.91 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  32.62 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  34.06 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  29.97 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  31.78 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  24.13 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.56 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.9 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  28.09 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  30 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  31.5 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.32 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  31.1 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  29.94 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25.41 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  28 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  28.43 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.81 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  31.05 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  28.76 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  27.35 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  31.34 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.89 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  31.87 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  31.01 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  23.74 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  29 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  20.83 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  29.89 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  23.96 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.63 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.46 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  30.04 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.56 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.22 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  26.77 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  27.98 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  30.45 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  27.05 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.74 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.64 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  26.17 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  30.81 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.88 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  25.87 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.37 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  29.27 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  25.12 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.24 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  26.7 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.23 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  26.7 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  23.71 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.11 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  21.33 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  22.61 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.07 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  26.26 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  23.57 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>