More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1525 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  100 
 
 
471 aa  961    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  54.55 
 
 
473 aa  523  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  52.68 
 
 
467 aa  481  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  47.45 
 
 
468 aa  435  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  49.02 
 
 
468 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  46.2 
 
 
472 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  43.4 
 
 
469 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  43.4 
 
 
469 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  42.68 
 
 
469 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  43.25 
 
 
465 aa  378  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  41.36 
 
 
467 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  41.58 
 
 
468 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  41.06 
 
 
468 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  40.8 
 
 
469 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  41.36 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  41.26 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  40.84 
 
 
468 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  39.83 
 
 
470 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  40.84 
 
 
468 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  40.72 
 
 
468 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  40.51 
 
 
468 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  39.87 
 
 
476 aa  342  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  41.06 
 
 
470 aa  335  7e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.81 
 
 
345 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  36.44 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  32.84 
 
 
467 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  34.69 
 
 
465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  34.26 
 
 
465 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  34.42 
 
 
464 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  34.13 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  33.19 
 
 
465 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  32.76 
 
 
463 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  33.33 
 
 
444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  32.84 
 
 
481 aa  212  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  31.8 
 
 
473 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  27.83 
 
 
438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  31.76 
 
 
481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  30.67 
 
 
449 aa  186  9e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  30.72 
 
 
484 aa  183  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  29.13 
 
 
576 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  27.84 
 
 
579 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  28.93 
 
 
576 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  27.66 
 
 
592 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  30.54 
 
 
450 aa  169  7e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  27.03 
 
 
504 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  27.99 
 
 
576 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  28.04 
 
 
575 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  27.72 
 
 
576 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  27.77 
 
 
585 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  26.5 
 
 
579 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  26.09 
 
 
579 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  27.48 
 
 
576 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  26.61 
 
 
579 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  27.66 
 
 
508 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  29.15 
 
 
525 aa  146  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  28.47 
 
 
534 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.42 
 
 
578 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  29.52 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  28.71 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.95 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  29.22 
 
 
533 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  29.14 
 
 
547 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  28.92 
 
 
547 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  28.7 
 
 
547 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  24.76 
 
 
456 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  45.78 
 
 
108 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  28.35 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  30.77 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  32.33 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  32.14 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  33.56 
 
 
403 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  38.46 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  32.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  32.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  32.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  32.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  32.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  32.89 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  32.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  30.41 
 
 
460 aa  64.3  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  30.92 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  33.02 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  31.36 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  31.01 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.94 
 
 
452 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.04 
 
 
366 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.74 
 
 
363 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  34.39 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  31.33 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  32.58 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.33 
 
 
365 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  29.14 
 
 
396 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  32.22 
 
 
512 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  37.5 
 
 
396 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.94 
 
 
376 aa  56.6  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  29.01 
 
 
407 aa  57  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  35.78 
 
 
424 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  34.12 
 
 
480 aa  56.6  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.66 
 
 
442 aa  56.6  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0080  peptidase M20  37.97 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>