275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0837 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  53.51 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  56.19 
 
 		 202 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  45.78 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  35.96 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 202 aa  98.2  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  40.27 
 
 		 212 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  34.78 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.57 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  34.23 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 285 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.23 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  28.51 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  27.93 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  30.72 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  30.07 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>