More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0169 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 
711 aa  1370    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
692 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.8 
 
 
688 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.74 
 
 
697 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.33 
 
 
693 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 
700 aa  186  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  42.97 
 
 
713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  37.04 
 
 
591 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.33 
 
 
697 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.87 
 
 
750 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 
754 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
594 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
643 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.12 
 
 
579 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.37 
 
 
952 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
709 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  26.74 
 
 
670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  28.85 
 
 
676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  31.83 
 
 
753 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 
688 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.57 
 
 
573 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1390 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1390 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1390 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
1370 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  35.62 
 
 
1432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.92 
 
 
1225 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  33.7 
 
 
765 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 
744 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 
713 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.74 
 
 
616 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
1385 aa  111  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  33.07 
 
 
537 aa  111  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
1248 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.52 
 
 
692 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
1711 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  34.67 
 
 
776 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 
1039 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  37.33 
 
 
851 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.74 
 
 
743 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
1361 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  35.02 
 
 
828 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.34 
 
 
585 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  38.19 
 
 
618 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  38.01 
 
 
855 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.72 
 
 
1045 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.37 
 
 
702 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  35.07 
 
 
583 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.37 
 
 
817 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.82 
 
 
523 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.04 
 
 
672 aa  97.8  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  32.39 
 
 
574 aa  98.2  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 
544 aa  97.4  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 
760 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.05 
 
 
775 aa  95.5  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 
738 aa  95.1  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
1383 aa  94.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  33.11 
 
 
757 aa  94.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 
1017 aa  94.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  32.36 
 
 
614 aa  94  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.12 
 
 
1051 aa  94  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  30.14 
 
 
618 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
549 aa  93.6  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  27.78 
 
 
644 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  31.45 
 
 
716 aa  94  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  30.12 
 
 
716 aa  92  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  27.76 
 
 
721 aa  91.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
887 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  31.37 
 
 
488 aa  90.9  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  29.57 
 
 
627 aa  90.5  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  25.07 
 
 
445 aa  90.5  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  31.28 
 
 
438 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.3 
 
 
1332 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.37 
 
 
560 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.23 
 
 
566 aa  88.2  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  37.25 
 
 
632 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  39.24 
 
 
395 aa  87.8  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  37.09 
 
 
760 aa  87.4  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.74 
 
 
847 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  33.94 
 
 
772 aa  87  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 
413 aa  87  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  27.01 
 
 
445 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.23 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  29.53 
 
 
771 aa  86.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  29.7 
 
 
580 aa  86.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  31.78 
 
 
377 aa  86.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 
723 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.57 
 
 
961 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.67 
 
 
631 aa  85.5  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  33 
 
 
570 aa  84.7  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.62 
 
 
583 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  32.13 
 
 
607 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 
393 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 
393 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 
393 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  31.23 
 
 
652 aa  83.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  31.78 
 
 
376 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.21 
 
 
693 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>