More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6046 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6046  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 751 aa  1505    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  44.88 
 
 		 670 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  44.97 
 
 		 667 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  44.97 
 
 		 667 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  44.67 
 
 		 665 aa  465  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.81 
 
 		 670 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.12 
 
 		 670 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  46.36 
 
 		 677 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.65 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.65 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.65 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.83 
 
 		 669 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.65 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  41.91 
 
 		 672 aa  458  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  44.69 
 
 		 670 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.28 
 
 		 669 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.46 
 
 		 669 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.46 
 
 		 669 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.1 
 
 		 669 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.46 
 
 		 669 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.28 
 
 		 669 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.12 
 
 		 776 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.26 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  47.83 
 
 		 666 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.12 
 
 		 776 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3600  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.97 
 
 		 776 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.02 
 
 		 776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  42.96 
 
 		 673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  42.6 
 
 		 668 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.07 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  42.54 
 
 		 663 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30290  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.68 
 
 		 784 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.94 
 
 		 786 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  42.45 
 
 		 662 aa  442  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.01 
 
 		 683 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.78 
 
 		 672 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  41.8 
 
 		 663 aa  438  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  42.31 
 
 		 668 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  37.23 
 
 		 670 aa  439  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  44.75 
 
 		 684 aa  438  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  38.25 
 
 		 673 aa  439  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  42.54 
 
 		 689 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  42.91 
 
 		 675 aa  436  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  42.62 
 
 		 690 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  45.16 
 
 		 672 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0011  DNA ligase, NAD-dependent  37.4 
 
 		 794 aa  433  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.996124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.15 
 
 		 787 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  42.54 
 
 		 672 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  42.7 
 
 		 661 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  39.73 
 
 		 668 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  42.42 
 
 		 711 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  42.29 
 
 		 685 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  42.68 
 
 		 684 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  43.93 
 
 		 678 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  36.56 
 
 		 674 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  42.16 
 
 		 690 aa  429  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1801  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.31 
 
 		 785 aa  426  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0162634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.4 
 
 		 669 aa  425  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  39.41 
 
 		 669 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  44.28 
 
 		 691 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  38.4 
 
 		 711 aa  425  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  41.98 
 
 		 690 aa  426  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  42.99 
 
 		 694 aa  426  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  41.98 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  42.01 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  34.88 
 
 		 681 aa  421  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3656  DNA ligase, NAD-dependent  37.24 
 
 		 787 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  41.81 
 
 		 700 aa  420  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3804  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.29 
 
 		 794 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  43.66 
 
 		 671 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  42.01 
 
 		 685 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  42.01 
 
 		 685 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 685 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  39.05 
 
 		 670 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  42.36 
 
 		 678 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  42.52 
 
 		 718 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  41.56 
 
 		 674 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  43.22 
 
 		 659 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.95 
 
 		 669 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.73 
 
 		 721 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.35 
 
 		 670 aa  419  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.79 
 
 		 774 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44660  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.87 
 
 		 794 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139158  normal  0.0637496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.37 
 
 		 671 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  42.37 
 
 		 671 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  43.31 
 
 		 669 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  42.47 
 
 		 675 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  42.23 
 
 		 675 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.93 
 
 		 684 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  34.54 
 
 		 678 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.37 
 
 		 671 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  42 
 
 		 667 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1336  DNA ligase, NAD-dependent  36.96 
 
 		 813 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.528438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1272  DNA ligase, NAD-dependent  36.65 
 
 		 817 aa  416  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.229595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.4 
 
 		 671 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  44.13 
 
 		 681 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  39.96 
 
 		 677 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.37 
 
 		 671 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.4 
 
 		 671 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.4 
 
 		 671 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>