160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0044 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  100 
 
 		 151 aa  290  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  57.72 
 
 		 156 aa  173  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  59.06 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  47.97 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  41.89 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  42 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  36.2 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  40.14 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  38.93 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  37.12 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  34.78 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  42.71 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  38.03 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  34.29 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  31.69 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  41.76 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  44.44 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  34.97 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  44.19 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  43.37 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  46.67 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  43.53 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  33.58 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  48.48 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  33.58 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  56.9 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  38.16 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  53.12 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  38.89 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  41.79 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  46.27 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  38.46 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  48 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  44 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  39.08 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  50 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  43.08 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  42.11 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44.29 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  38.71 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  39.73 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  33.57 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  31.21 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  41.79 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  41.79 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  39.13 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  45.83 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  28.47 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  47.22 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  33.81 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  29.53 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0596  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.9 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  26.43 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.53 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  25.32 
 
 		 515 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  38.03 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  40 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  24.83 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.03 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  23.45 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.72 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  32.46 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  24.11 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  40.74 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  35.21 
 
 		 316 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  33.71 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  38.89 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  28.08 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  32.88 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  32.91 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  25.32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  24.66 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  39.34 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.59 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  25.15 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.59 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  44.9 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  25.15 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>