196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2173 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 421 aa  868    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  51.07 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.24 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50 
 
 		 412 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  47.61 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  42.48 
 
 		 420 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  28.75 
 
 		 544 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  28.15 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  28.51 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  24.71 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  26.67 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  28.17 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1276 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  26.53 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  31.52 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.99 
 
 		 1056 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  30.66 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  30.4 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 927 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 243 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 4079 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  32.12 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.77 
 
 		 1001 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  27.7 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.03 
 
 		 1979 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  32.12 
 
 		 546 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  31.39 
 
 		 585 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 565 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 217 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0930  sporulation protein and related proteins  29.27 
 
 		 568 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  27.04 
 
 		 582 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1069 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 1094 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.84 
 
 		 576 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 4489 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  26.49 
 
 		 1067 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 		 632 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 667 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  29.59 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  24.41 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1257  hypothetical protein  27 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 566 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.46 
 
 		 1078 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 543 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  29.93 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.49 
 
 		 810 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  22.79 
 
 		 519 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 700 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  28.38 
 
 		 257 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 562 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1096 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.55 
 
 		 305 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  26.38 
 
 		 306 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  29.81 
 
 		 612 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 878 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 213 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  27.48 
 
 		 198 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1138 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  27.94 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 643 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 568 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 963 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 620 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.14 
 
 		 784 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 3560 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  24.43 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1827 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 288 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 245 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6030  hypothetical protein  21.47 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.08 
 
 		 818 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 900 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 187 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  23.4 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1276 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.68 
 
 		 620 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.15 
 
 		 832 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 648 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 808 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  28.77 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  27.4 
 
 		 779 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 573 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>