156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2510 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  41.43 
 
 		 4391 aa  727    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  41.06 
 
 		 4312 aa  710    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  42.56 
 
 		 1806 aa  796    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 2637 aa  5210    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  52.46 
 
 		 1349 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  40.84 
 
 		 1626 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  52.28 
 
 		 1327 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  52.28 
 
 		 1327 aa  561  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  51.26 
 
 		 1594 aa  549  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  53.56 
 
 		 1327 aa  519  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  50.09 
 
 		 1579 aa  511  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  54.27 
 
 		 466 aa  504  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1165 aa  500  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1165 aa  500  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  46.6 
 
 		 773 aa  435  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.96 
 
 		 868 aa  434  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  52.02 
 
 		 955 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  51.73 
 
 		 955 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  33.05 
 
 		 1102 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  42.31 
 
 		 989 aa  362  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  47.92 
 
 		 338 aa  312  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  46.25 
 
 		 306 aa  301  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  30.09 
 
 		 1753 aa  298  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  30.04 
 
 		 1762 aa  290  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  30.04 
 
 		 1762 aa  290  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.77 
 
 		 1763 aa  287  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2123  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 1297 aa  286  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.590284  normal  0.395646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  29.3 
 
 		 1770 aa  281  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.29 
 
 		 806 aa  280  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 		 1748 aa  278  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 1770 aa  277  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  30.44 
 
 		 3322 aa  276  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.39 
 
 		 2057 aa  269  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  37.5 
 
 		 1004 aa  262  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  38.53 
 
 		 997 aa  253  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  34.45 
 
 		 1234 aa  251  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  31.51 
 
 		 1277 aa  220  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  32.33 
 
 		 1234 aa  215  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.45 
 
 		 1234 aa  213  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  31.15 
 
 		 1250 aa  211  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  31.32 
 
 		 1234 aa  209  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  30.96 
 
 		 1252 aa  205  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  30.8 
 
 		 1250 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.32 
 
 		 950 aa  199  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  30.84 
 
 		 1254 aa  200  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  32.02 
 
 		 1113 aa  191  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.01 
 
 		 2578 aa  188  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.01 
 
 		 2906 aa  188  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  33.01 
 
 		 1861 aa  184  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  31.66 
 
 		 1108 aa  183  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  30.48 
 
 		 1099 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  29.55 
 
 		 995 aa  164  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  30.83 
 
 		 1093 aa  161  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  30.83 
 
 		 1093 aa  161  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.23 
 
 		 1086 aa  160  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.92 
 
 		 861 aa  160  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.64 
 
 		 2926 aa  159  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.21 
 
 		 3415 aa  153  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.82 
 
 		 3420 aa  152  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  28.66 
 
 		 1571 aa  149  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.8 
 
 		 1115 aa  145  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  29.92 
 
 		 1593 aa  142  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  29.84 
 
 		 1012 aa  135  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.17 
 
 		 1023 aa  131  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.11 
 
 		 1028 aa  120  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.17 
 
 		 1741 aa  119  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.82 
 
 		 825 aa  115  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.88 
 
 		 1067 aa  112  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  26.55 
 
 		 1040 aa  109  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  25.55 
 
 		 818 aa  104  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28.5 
 
 		 1259 aa  100  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 		 1070 aa  100  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  28.5 
 
 		 1269 aa  100  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.67 
 
 		 1070 aa  99  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  28.26 
 
 		 1254 aa  99  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.78 
 
 		 1259 aa  97.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  30.1 
 
 		 1268 aa  98.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.26 
 
 		 1285 aa  97.1  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  25.85 
 
 		 1068 aa  96.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  25.15 
 
 		 909 aa  92.8  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  25.9 
 
 		 947 aa  90.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.3 
 
 		 1357 aa  88.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  22.99 
 
 		 638 aa  82.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  22.99 
 
 		 638 aa  81.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  22.99 
 
 		 638 aa  81.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.12 
 
 		 870 aa  81.3  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  45.04 
 
 		 914 aa  80.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  44.53 
 
 		 927 aa  79.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.25 
 
 		 924 aa  75.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.44 
 
 		 1009 aa  75.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.03 
 
 		 854 aa  75.9  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.62 
 
 		 855 aa  75.1  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  61.76 
 
 		 506 aa  70.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  61.76 
 
 		 506 aa  70.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.08 
 
 		 773 aa  68.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.46 
 
 		 863 aa  68.2  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  42.86 
 
 		 1049 aa  67.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.9 
 
 		 820 aa  67  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0204  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.72 
 
 		 857 aa  64.7  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  29.17 
 
 		 1119 aa  63.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>