More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1216 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  424  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  60.4 
 
 		 188 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  47.12 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  52.6 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  44.72 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  48.95 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  50.67 
 
 		 192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  41.36 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  52.88 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 186 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  37.95 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  42.64 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  51.25 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  59.42 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 186 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  48.61 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  39.39 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  41.84 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  55.93 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 335 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  35.64 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>