69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7277 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
237 aa  483  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  50 
 
 
230 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  47.83 
 
 
261 aa  221  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  50 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  45.49 
 
 
239 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  42.49 
 
 
222 aa  188  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  42.21 
 
 
247 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  39.24 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  39.54 
 
 
260 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  39.18 
 
 
226 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  41.78 
 
 
453 aa  167  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  41.45 
 
 
242 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  40.27 
 
 
440 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  32.79 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  39.64 
 
 
240 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  39.13 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  36.02 
 
 
452 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  35.56 
 
 
455 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  36.17 
 
 
272 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  32.78 
 
 
240 aa  135  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.32 
 
 
451 aa  82  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  27.91 
 
 
1145 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  27.48 
 
 
1140 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  24.57 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.36 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.71 
 
 
1444 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.92 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  29.44 
 
 
193 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  26.25 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  31.17 
 
 
198 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  27.78 
 
 
501 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  27.19 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.7 
 
 
1505 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  27.51 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  26.73 
 
 
515 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.32 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
451 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  27.71 
 
 
217 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  27.03 
 
 
453 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  29.76 
 
 
321 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  27.16 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  25.81 
 
 
212 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
247 aa  51.6  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  25.1 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  23.37 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  25.62 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  27.42 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  25.12 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  23.87 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  23.46 
 
 
313 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  25.45 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  25.15 
 
 
234 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  28.48 
 
 
322 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  27.32 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  28.92 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  24 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  22.52 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  26.62 
 
 
326 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  24.19 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  24.18 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  25.66 
 
 
308 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  21.53 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>