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for query gene Cpin_0442 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 363 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  33.52 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  27.09 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 648 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 650 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  33.01 
 
 		 534 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  32.77 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  32.2 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 533 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 569 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
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NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  36 
 
 		 543 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 570 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
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NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  38.28 
 
 		 240 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 352 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 351 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  34.2 
 
 		 562 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
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NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 614 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  26.63 
 
 		 627 aa  93.6  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 590 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  24.25 
 
 		 624 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  26.03 
 
 		 627 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  26.63 
 
 		 627 aa  89.7  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  35.36 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 400 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 413 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  22.71 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  26.49 
 
 		 624 aa  86.3  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  26.34 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  23.1 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.69 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  42.17 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  28.25 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  37 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  26.42 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  37.29 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2145  MscS mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 537 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000018711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  24.17 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  26.88 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  27.92 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0969  mechanosensitive ion channel family protein  26.53 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  24.47 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  40.7 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  25.6 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  24.06 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  37.7 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  25.6 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  42.06 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
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NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
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NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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