111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2888 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 364 aa  757    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  54.87 
 
 		 383 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  52.65 
 
 		 814 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  53.5 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  52.09 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  52.08 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  50.28 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  50.7 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  48.6 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  47.22 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  48.08 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  45.68 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  45.38 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  47.76 
 
 		 386 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  45.83 
 
 		 783 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  47.47 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  46.77 
 
 		 375 aa  347  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  47.09 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  48.03 
 
 		 370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  43.51 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 		 783 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  44.86 
 
 		 376 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  44.32 
 
 		 376 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  38.62 
 
 		 391 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  39.24 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  38.65 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 415 aa  279  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  39.22 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  37.9 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  37.9 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  37.9 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  37.8 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  38.34 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  37.63 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  35.9 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  36.86 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  36.97 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  36.83 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  37.67 
 
 		 395 aa  261  8.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  36.22 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  36.15 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  37.33 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  37.87 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  37.67 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  39.32 
 
 		 460 aa  259  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  36.27 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  35.26 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  35.75 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  36.59 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  37.47 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.46 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  37.63 
 
 		 381 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  36.46 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  35.11 
 
 		 413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  39.55 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  36.78 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  36.26 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  38.55 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  35.99 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  36.91 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  35.71 
 
 		 383 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  36.84 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  36.34 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  35.08 
 
 		 381 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  36.41 
 
 		 399 aa  235  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  38.33 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  38.06 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  35.83 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  35.85 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  34.44 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  33.61 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  35.83 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  26.56 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.32 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  26.29 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  29.11 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  26.64 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  27.01 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  25.94 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.71 
 
 		 449 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.27 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  26.14 
 
 		 524 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  25.14 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  24 
 
 		 500 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  22.98 
 
 		 494 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  23.78 
 
 		 499 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.86 
 
 		 459 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  23.89 
 
 		 511 aa  46.6  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25.58 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  20.98 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.81 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  30.12 
 
 		 437 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  38.1 
 
 		 434 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  17.97 
 
 		 722 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>