More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1900 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  51.3 
 
 		 766 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  53.45 
 
 		 673 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  52.46 
 
 		 736 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 581 aa  1212    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  51.85 
 
 		 761 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  57.22 
 
 		 624 aa  681    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  59.44 
 
 		 653 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  56.46 
 
 		 668 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  56.4 
 
 		 650 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  54.26 
 
 		 704 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  53.94 
 
 		 709 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  58.15 
 
 		 676 aa  689    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  59.03 
 
 		 630 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  53.47 
 
 		 709 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  51.3 
 
 		 715 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  56.66 
 
 		 667 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  61.43 
 
 		 610 aa  766    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  50 
 
 		 626 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  49.26 
 
 		 579 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  44.97 
 
 		 565 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  42.61 
 
 		 534 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  33.46 
 
 		 574 aa  265  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.12 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.87 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  26.1 
 
 		 472 aa  72  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  32.48 
 
 		 724 aa  67.8  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  26.93 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  24.82 
 
 		 570 aa  67  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  21.75 
 
 		 477 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  22.81 
 
 		 1847 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  21.89 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  33.96 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  33.96 
 
 		 734 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  22.78 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  21.94 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.47 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  20.47 
 
 		 543 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  29.91 
 
 		 671 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1124 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  30.33 
 
 		 667 aa  61.6  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1124 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  26.1 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  31.09 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.03 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1126 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  22.1 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 672 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  24.2 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  24.39 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  21.88 
 
 		 589 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  30.28 
 
 		 672 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1124 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.26 
 
 		 2068 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 566 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 571 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  24.37 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  21.68 
 
 		 692 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  22.36 
 
 		 1307 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.53 
 
 		 1891 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  29.51 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  32.58 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  24.32 
 
 		 604 aa  57.8  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  32.58 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  28.44 
 
 		 1130 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  22.91 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  30.33 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  34.83 
 
 		 1082 aa  57.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  23.89 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  29.51 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  24.1 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  22.1 
 
 		 610 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  23.45 
 
 		 694 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  28.23 
 
 		 1151 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  29.27 
 
 		 672 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  27.94 
 
 		 561 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  23.66 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 1130 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  22.78 
 
 		 1017 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 		 572 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 		 1022 aa  56.6  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.12 
 
 		 654 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  24.29 
 
 		 607 aa  56.6  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>