76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1315 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  52.61 
 
 
810 aa  671    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  53.86 
 
 
791 aa  656    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
788 aa  1556    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  89.23 
 
 
774 aa  1224    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  50.59 
 
 
788 aa  608  9.999999999999999e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  47.59 
 
 
793 aa  581  1e-164  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  47.19 
 
 
779 aa  560  1e-158  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  46.67 
 
 
781 aa  544  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  48.29 
 
 
787 aa  536  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  44.33 
 
 
775 aa  522  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  42.08 
 
 
778 aa  495  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  44.71 
 
 
810 aa  491  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
794 aa  460  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  42.49 
 
 
790 aa  410  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  45.83 
 
 
821 aa  367  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
716 aa  104  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 
675 aa  90.9  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
682 aa  88.2  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
693 aa  87.4  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  32.4 
 
 
615 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
557 aa  80.9  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.66 
 
 
607 aa  75.1  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
628 aa  73.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 
627 aa  73.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 
554 aa  70.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 
564 aa  70.5  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  25.39 
 
 
722 aa  62.4  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 
604 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 
604 aa  60.8  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 
547 aa  60.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  20.58 
 
 
735 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.72 
 
 
545 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
565 aa  59.3  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 
569 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
597 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 
559 aa  58.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.17 
 
 
557 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 
557 aa  57.4  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  20.39 
 
 
604 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
636 aa  54.7  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  21.83 
 
 
596 aa  54.3  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.11 
 
 
609 aa  53.9  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 
503 aa  54.3  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  31.76 
 
 
567 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 
616 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  21.82 
 
 
592 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 
581 aa  51.6  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 
522 aa  51.2  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  29.25 
 
 
538 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
559 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  31.5 
 
 
572 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 
634 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 
567 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
531 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  20 
 
 
621 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.16 
 
 
578 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  31.76 
 
 
620 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 
634 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 
584 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  19.85 
 
 
577 aa  48.5  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 
553 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 
636 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
544 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2119  hypothetical protein  24 
 
 
729 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  21.71 
 
 
565 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 
593 aa  45.8  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.4 
 
 
551 aa  45.8  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 
587 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.48 
 
 
587 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 
579 aa  45.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 
603 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
518 aa  44.3  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  20.23 
 
 
579 aa  44.3  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 
654 aa  44.3  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>