More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4655 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
375 aa  740    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.58 
 
 
1052 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  45.89 
 
 
2345 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2121  hemolysin-type calcium-binding region  50.43 
 
 
368 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190728  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  48.89 
 
 
1699 aa  84.7  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  45.39 
 
 
1166 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  50.41 
 
 
2667 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4762  hemolysin-type calcium-binding region  40.72 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  50.48 
 
 
467 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  44.07 
 
 
7284 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  51.28 
 
 
2452 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  47.17 
 
 
1883 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.89 
 
 
5962 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  51.11 
 
 
1502 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.51 
 
 
5839 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  47.67 
 
 
8682 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.79 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  51.72 
 
 
1019 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  53.62 
 
 
6753 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.99 
 
 
5098 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  46.51 
 
 
9030 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  40.52 
 
 
5218 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  56.52 
 
 
2542 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  49.51 
 
 
2689 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  65.45 
 
 
1055 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  42.31 
 
 
3314 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  42.31 
 
 
3608 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  46.81 
 
 
1394 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  40.4 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  45.92 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  40.4 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  47.12 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  47.12 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  40 
 
 
867 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  34.85 
 
 
542 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  44.09 
 
 
2105 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  48.57 
 
 
2704 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  47.73 
 
 
3091 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  48.11 
 
 
1202 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  46.24 
 
 
686 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  36.81 
 
 
2743 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  50 
 
 
3209 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.31 
 
 
1795 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.15 
 
 
3619 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  46.67 
 
 
606 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  38.03 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  44.34 
 
 
2537 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  52.63 
 
 
4798 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  47.73 
 
 
850 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  42.98 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.7 
 
 
2107 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  62.5 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  37.04 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  53.62 
 
 
4678 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  53.95 
 
 
504 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  34.55 
 
 
1383 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  46.51 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  51.04 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  50.62 
 
 
3619 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.18 
 
 
868 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  47.83 
 
 
709 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.77 
 
 
2239 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.04 
 
 
2668 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  51.85 
 
 
1534 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  46.05 
 
 
2245 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  59.32 
 
 
1855 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  53.16 
 
 
2911 aa  66.6  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
475 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  31.28 
 
 
760 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  54.55 
 
 
5171 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.13 
 
 
4106 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  42.42 
 
 
727 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.74 
 
 
3954 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  41.18 
 
 
481 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  39.2 
 
 
1175 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  50.6 
 
 
1421 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  47.46 
 
 
946 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  46.51 
 
 
486 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  62.71 
 
 
1424 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  42.86 
 
 
820 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  37.34 
 
 
950 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  42.57 
 
 
833 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  41.91 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  50.62 
 
 
518 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52 
 
 
588 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.86 
 
 
1372 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  51.32 
 
 
3427 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  40.46 
 
 
6662 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.33 
 
 
2678 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  40.46 
 
 
6779 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  50 
 
 
2178 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  48 
 
 
1164 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40.4 
 
 
589 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.46 
 
 
6683 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  50.67 
 
 
813 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  41.59 
 
 
2701 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  45.26 
 
 
4791 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.28 
 
 
260 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  63.93 
 
 
280 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>