More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0195 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  75.27 
 
 		 472 aa  692    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 		 468 aa  915    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  71.55 
 
 		 472 aa  627  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  70.6 
 
 		 470 aa  624  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  68.95 
 
 		 473 aa  595  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  63.25 
 
 		 467 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  62.53 
 
 		 468 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  40.12 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  38.34 
 
 		 533 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  41.59 
 
 		 517 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  39.04 
 
 		 502 aa  257  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.21 
 
 		 479 aa  242  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  37.62 
 
 		 509 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  30.47 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.91 
 
 		 542 aa  190  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  28.09 
 
 		 581 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  28.67 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  27.93 
 
 		 522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  31.44 
 
 		 883 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  30.21 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.6 
 
 		 892 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  30.07 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  26.62 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.33 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  29.66 
 
 		 523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  26.35 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  32.16 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  25.75 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  27.67 
 
 		 505 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  25.9 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  27.23 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  26.86 
 
 		 488 aa  140  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  26 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  29.77 
 
 		 568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  26.91 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  26.81 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  25.15 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  26.44 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  29.33 
 
 		 562 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.42 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  28.62 
 
 		 566 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  26.16 
 
 		 581 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.07 
 
 		 527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  29.89 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  31.1 
 
 		 566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.22 
 
 		 526 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.86 
 
 		 533 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.53 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.53 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.86 
 
 		 523 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.82 
 
 		 509 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  27.42 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.18 
 
 		 562 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.67 
 
 		 613 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.84 
 
 		 551 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  21.59 
 
 		 520 aa  94  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.31 
 
 		 523 aa  93.2  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.64 
 
 		 592 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.78 
 
 		 564 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.97 
 
 		 519 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.8 
 
 		 548 aa  90.9  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  25.2 
 
 		 570 aa  88.6  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.4 
 
 		 522 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.16 
 
 		 598 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  28.69 
 
 		 557 aa  86.7  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.04 
 
 		 537 aa  86.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.63 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.82 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.63 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.63 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.63 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.73 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.96 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.37 
 
 		 557 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  23.9 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.85 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  24.03 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.81 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  23.53 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  22.89 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.45 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  27.14 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 590 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  26.5 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  23.56 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.71 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.45 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  22.71 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.34 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.37 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.53 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.36 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  27 
 
 		 594 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.96 
 
 		 550 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>