More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5865 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  32.44 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  33.55 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  33.23 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  34.41 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  30.07 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  32.13 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  30.39 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  33.22 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  32.68 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  33.66 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  30.38 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.74 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  30.61 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.76 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  32.54 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  32.36 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.76 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  30.87 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.04 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.33 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.77 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  32.34 
 
 		 372 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  31.21 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  31.09 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  31.91 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  28.28 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.14 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.14 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.14 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.85 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.83 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.3 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.83 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  28.07 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  30.66 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  25.49 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.38 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.42 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  26.86 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.83 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  25.91 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  25.48 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  28.21 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.67 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  35.45 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  27.03 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  30.88 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.72 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.7 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  28.22 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>