More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2970 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 718 aa  1478    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  45.21 
 
 		 727 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  44.11 
 
 		 728 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  46.32 
 
 		 731 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  46.32 
 
 		 731 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  45.3 
 
 		 708 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  45.77 
 
 		 716 aa  560  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  44.35 
 
 		 744 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  40.25 
 
 		 697 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 675 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 654 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 657 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 674 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  34 
 
 		 682 aa  368  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 683 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.77 
 
 		 675 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 685 aa  360  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 667 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 668 aa  321  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 656 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 693 aa  283  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 663 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 656 aa  232  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 690 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.28 
 
 		 653 aa  183  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 665 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  21.85 
 
 		 678 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 775 aa  97.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 651 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 669 aa  93.6  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 670 aa  78.2  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 682 aa  76.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  21.92 
 
 		 666 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  21.92 
 
 		 666 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  21.92 
 
 		 666 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1571  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 804 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.579738  normal  0.0739696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 673 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.92 
 
 		 666 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 662 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  20.41 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 699 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.2 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  21.53 
 
 		 807 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  28.04 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 737 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  22.59 
 
 		 671 aa  64.3  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 692 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 749 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 656 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  22.34 
 
 		 809 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 729 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 647 aa  62  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 846 aa  62.4  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 845 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.59 
 
 		 639 aa  62  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.34 
 
 		 809 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  20.12 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 632 aa  60.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 809 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 642 aa  60.1  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.56 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  26.36 
 
 		 618 aa  57.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  22.65 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  21.06 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  22.37 
 
 		 701 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  26.36 
 
 		 746 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.38 
 
 		 613 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  31.11 
 
 		 623 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.97 
 
 		 666 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  19.56 
 
 		 764 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  26.18 
 
 		 746 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 680 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 686 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 735 aa  55.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.41 
 
 		 663 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 656 aa  55.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  22.26 
 
 		 696 aa  55.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 695 aa  55.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 681 aa  55.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  20.06 
 
 		 758 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  20.06 
 
 		 758 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 690 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>