More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3103 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  100 
 
 		 217 aa  417  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  59.11 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  55.88 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  53.11 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  58.82 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  54 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  48.97 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  50 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  49.25 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  47.19 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  46.15 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  46.82 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  45.03 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  39.1 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  40.56 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  36.2 
 
 		 196 aa  98.6  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  39.87 
 
 		 186 aa  98.6  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  39.1 
 
 		 177 aa  98.2  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  40.26 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.14 
 
 		 169 aa  97.8  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  32.79 
 
 		 178 aa  96.7  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  34.55 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  40.58 
 
 		 179 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  41.54 
 
 		 169 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  43.38 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  35.44 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  39.26 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  42.34 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  36.2 
 
 		 189 aa  93.2  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  42.65 
 
 		 177 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  32.98 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  40.3 
 
 		 178 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  39.55 
 
 		 178 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  32.98 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  33.93 
 
 		 191 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  39.55 
 
 		 178 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  34.38 
 
 		 186 aa  91.7  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  36.48 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  34.16 
 
 		 162 aa  91.7  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  39.13 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  41.35 
 
 		 170 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  38.81 
 
 		 178 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  41.84 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  37.74 
 
 		 184 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  39.37 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  37.97 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  38.06 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  38.41 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  38.64 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  39.71 
 
 		 170 aa  89.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  37.04 
 
 		 180 aa  89  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  35.22 
 
 		 174 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  42.86 
 
 		 177 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  38.85 
 
 		 177 aa  88.6  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  41.46 
 
 		 179 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  38.06 
 
 		 177 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  32.19 
 
 		 169 aa  88.6  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  37.21 
 
 		 171 aa  88.2  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  37.2 
 
 		 153 aa  88.2  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  36.2 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  37.58 
 
 		 158 aa  87.8  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  39.39 
 
 		 177 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  41.67 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  42.19 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  42.19 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  42.19 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  42.19 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  42.19 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  34.32 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  34.81 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  34.81 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  39.57 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  38.06 
 
 		 179 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  34.56 
 
 		 178 aa  86.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  37.89 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  34.38 
 
 		 164 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  34.33 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  41.41 
 
 		 177 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  41.41 
 
 		 177 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  40 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  35.19 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  34.97 
 
 		 201 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  35.76 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  34.97 
 
 		 201 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.02 
 
 		 171 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  34.97 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  40.44 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  40.15 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  38.37 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  34.59 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  37.72 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  34.18 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  35.42 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  34.15 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  39.57 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  37.25 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  38.22 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.42 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>