More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0970 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 366 aa  695    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.73 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.41 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0342  Polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.249196 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  30.28 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  38.73 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  37.27 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  27.27 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  36.97 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  37.04 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  37.01 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  38.25 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.51 
 
 		 362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  34.51 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  34.05 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  36.63 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  35.54 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  34.26 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  37.8 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  33.55 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  36.78 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  33.75 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  33.75 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  33.75 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  38.66 
 
 		 634 aa  126  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.92 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  39.87 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.3 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 1155 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  33.68 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  24.69 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  36.14 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  37.34 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  31.78 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29.49 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.78 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  31.78 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  28.9 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 374 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 374 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.64 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  37.07 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  32.74 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  34.17 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0636  polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  30.3 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  33.33 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  35.33 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  29.55 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  27.51 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  33.7 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  29.5 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  32.05 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.65 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 343 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  27.71 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  32.72 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  34.92 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  38.96 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  32.4 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  28.66 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  34.39 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.21 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  34.39 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  36.63 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0496  dimethylallyltransferase  32.59 
 
 		 575 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.432422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  33.73 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.71 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  31.06 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  31.67 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  25.85 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  29.24 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.09 
 
 		 338 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  27.8 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.95 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33 
 
 		 320 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  33.6 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.22 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 418 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 418 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 418 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  34.55 
 
 		 327 aa  96.3  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.03 
 
 		 322 aa  95.9  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  30.5 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  33.6 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>