More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6684 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  79.37 
 
 		 1149 aa  1836    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1149 aa  2341    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  59.96 
 
 		 1150 aa  1359    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  59.96 
 
 		 1150 aa  1358    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  59.76 
 
 		 1150 aa  1358    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  59.96 
 
 		 1150 aa  1358    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  34.69 
 
 		 1359 aa  513  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  31.56 
 
 		 1390 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  31.61 
 
 		 1402 aa  489  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  32.67 
 
 		 1410 aa  486  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  31.3 
 
 		 1418 aa  483  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  32.6 
 
 		 1411 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  32.06 
 
 		 1386 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  31.76 
 
 		 1385 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  31.66 
 
 		 1400 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1409 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  31.59 
 
 		 1229 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  30.74 
 
 		 1379 aa  422  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1419 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.74 
 
 		 1568 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  31.08 
 
 		 1531 aa  363  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  29.57 
 
 		 1140 aa  335  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.26 
 
 		 1446 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.97 
 
 		 1421 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  32.47 
 
 		 924 aa  303  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  30.6 
 
 		 867 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.36 
 
 		 1348 aa  293  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  29.76 
 
 		 866 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.37 
 
 		 1485 aa  285  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1197 aa  283  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.41 
 
 		 1530 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  31.3 
 
 		 855 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.15 
 
 		 1362 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1520 aa  263  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1527 aa  262  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.77 
 
 		 1611 aa  262  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.76 
 
 		 1586 aa  260  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.6 
 
 		 1572 aa  259  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.31 
 
 		 1595 aa  258  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.91 
 
 		 1576 aa  258  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1547 aa  257  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1551 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  27.21 
 
 		 1508 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1550 aa  253  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1319 aa  251  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.05 
 
 		 1528 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.62 
 
 		 1560 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.87 
 
 		 1489 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1317 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1554 aa  241  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.64 
 
 		 1614 aa  240  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.97 
 
 		 1259 aa  238  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1586 aa  238  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1583 aa  237  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1604 aa  235  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1654 aa  234  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.38 
 
 		 1488 aa  232  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.13 
 
 		 1518 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.53 
 
 		 1495 aa  227  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.89 
 
 		 1509 aa  221  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1381 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1541 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1541 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  30.71 
 
 		 555 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1541 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1541 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.38 
 
 		 1573 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.62 
 
 		 1528 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1541 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 		 561 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1541 aa  214  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.52 
 
 		 1981 aa  211  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.42 
 
 		 1609 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.38 
 
 		 1384 aa  203  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.27 
 
 		 1517 aa  202  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.5 
 
 		 1429 aa  201  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.2 
 
 		 1494 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1494 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1189 aa  199  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1602 aa  198  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1495 aa  194  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1527 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1352 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1492 aa  192  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1487 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25 
 
 		 1552 aa  188  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.1 
 
 		 2035 aa  187  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25.28 
 
 		 1543 aa  187  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  35.93 
 
 		 451 aa  186  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1466 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  37.54 
 
 		 480 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.67 
 
 		 1539 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.8 
 
 		 2149 aa  181  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.23 
 
 		 1381 aa  178  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  23.67 
 
 		 1593 aa  177  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  24.32 
 
 		 1539 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.74 
 
 		 1434 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.17 
 
 		 2096 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1553 aa  173  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  30.37 
 
 		 598 aa  167  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>