More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1269 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  66.54 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 266 aa  298  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  56.36 
 
 		 256 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  35.71 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  35.71 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  35.71 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  39.52 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 231 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  35.71 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  35.71 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  39.89 
 
 		 228 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  38.57 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  35.24 
 
 		 231 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  38.5 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  35.24 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  34.62 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  37.08 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  36.54 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 239 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  34.62 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  34.63 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  38.3 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 		 227 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 		 248 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 		 222 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  35.89 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.03 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  33.82 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  34.74 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  36.1 
 
 		 241 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.04 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.6 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  34.58 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  33.84 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  34.58 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  34.58 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 221 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  33.65 
 
 		 231 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 		 226 aa  99  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  38.07 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 228 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  32.23 
 
 		 231 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 		 223 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  28.12 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  35.11 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  35.12 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 192 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  30.43 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>