More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1584 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  22.33 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  20.24 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  23.63 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0393  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 173 aa  52  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  22.83 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 287 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  23.12 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  23.75 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  18.39 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  25 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 72 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 497 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  20.22 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>