More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1221 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 910 aa  1834    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 912 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 907 aa  223  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 908 aa  218  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  24.7 
 
 		 893 aa  181  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 894 aa  125  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  24.75 
 
 		 884 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  29.93 
 
 		 867 aa  112  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  24.28 
 
 		 864 aa  101  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 		 845 aa  100  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 856 aa  98.2  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  28.29 
 
 		 865 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  24.84 
 
 		 884 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  30.11 
 
 		 880 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 926 aa  77  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  25.8 
 
 		 868 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 956 aa  68.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  55.38 
 
 		 879 aa  68.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  56.86 
 
 		 934 aa  68.2  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 876 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  26.28 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 903 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 889 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 904 aa  65.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 928 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.91 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  23.69 
 
 		 893 aa  65.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  61.54 
 
 		 905 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  54.72 
 
 		 1001 aa  64.3  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  54.9 
 
 		 955 aa  64.3  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  52.94 
 
 		 961 aa  64.3  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 918 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  27.5 
 
 		 562 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 950 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  26.23 
 
 		 903 aa  63.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 923 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  52.94 
 
 		 923 aa  63.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 775 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 927 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40.66 
 
 		 910 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 959 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 953 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 937 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 937 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  55.56 
 
 		 929 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 937 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  52.94 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 818 aa  61.6  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  43.55 
 
 		 940 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  60.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  50.98 
 
 		 232 aa  60.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  52.94 
 
 		 884 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 218 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  44.83 
 
 		 930 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 224 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56.86 
 
 		 907 aa  60.1  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 900 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  56.86 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  57.69 
 
 		 928 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 755 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 232 aa  59.7  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 232 aa  59.7  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 956 aa  58.9  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  33.09 
 
 		 895 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 814 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 936 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 882 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 879 aa  58.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 940 aa  58.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 929 aa  58.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  49.12 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 208 aa  57  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 959 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 229 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 950 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 909 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 243 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 454 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  27.09 
 
 		 871 aa  57.4  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 938 aa  57  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 217 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 231 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 894 aa  56.6  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>