More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3678 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3678  integrase family protein  100 
 
 
275 aa  543  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  32.77 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  33.56 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.84 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.22 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  30.83 
 
 
399 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  28.88 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.09 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  33.14 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  27.35 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  26.38 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  27.24 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.21 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.19 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.47 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.47 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.91 
 
 
443 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.02 
 
 
391 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.48 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.39 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  30.61 
 
 
421 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  27.78 
 
 
334 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.41 
 
 
392 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  23.51 
 
 
437 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.66 
 
 
383 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  28.03 
 
 
326 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  22.61 
 
 
431 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  32.76 
 
 
415 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.97 
 
 
429 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  27.56 
 
 
394 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  25.42 
 
 
343 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  25.85 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.24 
 
 
391 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.06 
 
 
353 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.46 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  25.42 
 
 
350 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  25.85 
 
 
338 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  22.93 
 
 
301 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.95 
 
 
477 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  26.69 
 
 
339 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  29.81 
 
 
188 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  34.46 
 
 
159 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  32.91 
 
 
392 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  30.64 
 
 
392 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  27.62 
 
 
374 aa  58.9  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  31.08 
 
 
398 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  31.07 
 
 
386 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  30.64 
 
 
392 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  28.83 
 
 
422 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.02 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  29.9 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  31.33 
 
 
417 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  26.37 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.37 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.67 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.15 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  27.47 
 
 
374 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  26.75 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  27.17 
 
 
407 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  49.12 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  34.55 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  31.93 
 
 
191 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.3 
 
 
172 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  29.75 
 
 
405 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  25.64 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.34 
 
 
400 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  24.6 
 
 
354 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  28.95 
 
 
381 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.6 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.6 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.6 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.97 
 
 
367 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.6 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.6 
 
 
300 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  64.1 
 
 
338 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  26.15 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  26.99 
 
 
438 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  47.37 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  33.05 
 
 
121 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  22.76 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  34.21 
 
 
343 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  31.17 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  29.07 
 
 
463 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  24.6 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  58.97 
 
 
405 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.52 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  24.19 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  25.82 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  24.57 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  27.31 
 
 
399 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  26.53 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  28.57 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  24.36 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.78 
 
 
370 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  27.02 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  33.33 
 
 
335 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  28.12 
 
 
342 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>