More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0866 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  100 
 
 		 405 aa  771    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  52.48 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  52.94 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  48.64 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  48.13 
 
 		 404 aa  299  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  48.85 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  45.94 
 
 		 402 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  38.82 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  36.86 
 
 		 396 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.37 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  35.22 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.96 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.56 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31.3 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  35.87 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.53 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.93 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  28.31 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.46 
 
 		 428 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  33.07 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.43 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  35.07 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  35.26 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  34.18 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  33.69 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.48 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  35.86 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  32.02 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.05 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.46 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  35.57 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.59 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  35.01 
 
 		 425 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  35.43 
 
 		 401 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.53 
 
 		 417 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.86 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.76 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  32.56 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  37.08 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.9 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  31.37 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.33 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30.31 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.63 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  33.92 
 
 		 414 aa  136  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  35.43 
 
 		 393 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.52 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  34.75 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.46 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  36.87 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  28.24 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.26 
 
 		 406 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  33.86 
 
 		 392 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  36.14 
 
 		 403 aa  132  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.62 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  34.75 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  35.48 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  34.31 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  34.34 
 
 		 448 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.57 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  27.66 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.83 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  30.61 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.65 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  34.21 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  25.27 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.32 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  34.52 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.42 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  38.39 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  28.42 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.98 
 
 		 303 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  35.56 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  27.39 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  29.29 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 374 aa  126  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  47.18 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  31.83 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  33.59 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  33.93 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  34.67 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  30.77 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  35.22 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  34.41 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  34.73 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  31.03 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  23.23 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  32.18 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.07 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
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NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.5 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  34.68 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.99 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  33.42 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  31.22 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.77 
 
 		 389 aa  120  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  30.42 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA1189  ROK family protein  31.21 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  28.98 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  32.05 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  33.33 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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