131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2033 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  100 
 
 
591 aa  1175    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  58.04 
 
 
421 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  92.56 
 
 
763 aa  330  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  99.23 
 
 
460 aa  243  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  42.96 
 
 
492 aa  223  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  41 
 
 
338 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  43.14 
 
 
526 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  42.37 
 
 
514 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  41.58 
 
 
561 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  39.73 
 
 
552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  30.24 
 
 
597 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  30.85 
 
 
504 aa  153  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  31.38 
 
 
453 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  31.65 
 
 
453 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  31.38 
 
 
453 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  31.38 
 
 
453 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  31.38 
 
 
453 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  31.38 
 
 
449 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  31.38 
 
 
453 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  31.7 
 
 
426 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  33.42 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  55.3 
 
 
510 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  32 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  32.77 
 
 
539 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  32.45 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  32.45 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  55.04 
 
 
261 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  32.22 
 
 
451 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  56.59 
 
 
551 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  33.87 
 
 
1194 aa  137  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  55.04 
 
 
648 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  53.68 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  29.74 
 
 
451 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  30.16 
 
 
451 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  32.69 
 
 
507 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  29.37 
 
 
540 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  52.67 
 
 
490 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  31.74 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  47.1 
 
 
680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  27.91 
 
 
543 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  32.33 
 
 
2305 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  31.25 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  30.38 
 
 
562 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  33.83 
 
 
593 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  27.38 
 
 
537 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  33.46 
 
 
665 aa  108  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  33.07 
 
 
315 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  27.27 
 
 
623 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  35.98 
 
 
2310 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  28.99 
 
 
751 aa  96.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  28.16 
 
 
358 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  29.41 
 
 
897 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  29.08 
 
 
897 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  29.08 
 
 
897 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  29.41 
 
 
686 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  29.41 
 
 
686 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  26.76 
 
 
393 aa  90.5  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  27.78 
 
 
324 aa  88.2  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  30.04 
 
 
481 aa  87.4  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  27.86 
 
 
324 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  28.46 
 
 
465 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  24.26 
 
 
548 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  40.4 
 
 
904 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  62.75 
 
 
675 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  28 
 
 
358 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  57.41 
 
 
651 aa  65.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  61.7 
 
 
772 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  56.52 
 
 
353 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  25.13 
 
 
361 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  40.15 
 
 
2031 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  55.1 
 
 
727 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  49.18 
 
 
848 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  36.99 
 
 
296 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  26.97 
 
 
671 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  59.52 
 
 
563 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  51.92 
 
 
295 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  55.77 
 
 
353 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  42.86 
 
 
600 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 
1281 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  54.17 
 
 
855 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  37.5 
 
 
433 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  40.85 
 
 
855 aa  54.7  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  24 
 
 
461 aa  53.9  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  28.7 
 
 
365 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.83 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  28.52 
 
 
436 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  51.16 
 
 
367 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  39.29 
 
 
1057 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  43.1 
 
 
699 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  47.83 
 
 
489 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  33.7 
 
 
634 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  50 
 
 
426 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  45.9 
 
 
729 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  45.9 
 
 
729 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  34.52 
 
 
812 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  60.32 
 
 
407 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.93 
 
 
257 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  36.14 
 
 
521 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  29.61 
 
 
1024 aa  51.2  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  44.26 
 
 
443 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>