More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2260 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  396  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  30.89 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  25.71 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  30.57 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  39 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 428 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 367 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  29.71 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  25.89 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  29.65 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 510 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  18.93 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  22.51 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  41.07 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>