More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1797 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  100 
 
 
452 aa  899  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  64.4 
 
 
453 aa  563  1e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.15082e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  58.89 
 
 
459 aa  518  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  58.11 
 
 
459 aa  519  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  52.62 
 
 
453 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.62 
 
 
464 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.11 
 
 
457 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.77 
 
 
471 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.76 
 
 
476 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  37.5 
 
 
500 aa  290  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  43.99 
 
 
478 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.68 
 
 
386 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.82436e-09  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.56 
 
 
466 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.28 
 
 
476 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.81376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  43.42 
 
 
467 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.75 
 
 
428 aa  285  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.68 
 
 
458 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  47.55 
 
 
462 aa  284  2e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.86 
 
 
464 aa  283  4e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  37.75 
 
 
478 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.5 
 
 
384 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.25 
 
 
472 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.99 
 
 
476 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.99 
 
 
476 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.09 
 
 
461 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.1 
 
 
474 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  40.39 
 
 
475 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.85 
 
 
474 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  47.48 
 
 
382 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  35.14 
 
 
473 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  44.27 
 
 
472 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.60419e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  34.79 
 
 
481 aa  275  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  40.33 
 
 
503 aa  275  9e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  37.69 
 
 
514 aa  275  2e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  38 
 
 
469 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  43.21 
 
 
473 aa  273  5e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  37.47 
 
 
514 aa  273  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  43.38 
 
 
424 aa  272  8e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40 
 
 
497 aa  271  1e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  36.3 
 
 
473 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  44.28 
 
 
408 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 
375 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  43.67 
 
 
411 aa  270  3e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  44.28 
 
 
408 aa  270  3e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  35.37 
 
 
511 aa  270  3e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  35.15 
 
 
503 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  36.34 
 
 
500 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  34.5 
 
 
503 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  42.5 
 
 
474 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  39.86 
 
 
489 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  2.25032e-08  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 
479 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  35.45 
 
 
493 aa  267  3e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.48 
 
 
485 aa  267  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  37.87 
 
 
484 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  36.53 
 
 
476 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.69 
 
 
481 aa  266  6e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  42.2 
 
 
535 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.35 
 
 
386 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  42.9 
 
 
415 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  35.19 
 
 
464 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.46 
 
 
479 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  35.99 
 
 
476 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  35.29 
 
 
528 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  37.18 
 
 
471 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.92 
 
 
381 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.31 
 
 
415 aa  263  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 
412 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  33.77 
 
 
505 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  35.12 
 
 
516 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.66487e-09 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  40.58 
 
 
444 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.89 
 
 
385 aa  263  7e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  35.54 
 
 
473 aa  262  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  45.67 
 
 
379 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  4.2799e-08 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  42.82 
 
 
397 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  38.42 
 
 
483 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  43.2 
 
 
388 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.48342e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  37.87 
 
 
473 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  34.5 
 
 
498 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  42.82 
 
 
383 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  35.91 
 
 
490 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  38.33 
 
 
501 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.8 
 
 
456 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.01293e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  35.98 
 
 
474 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  38.85 
 
 
491 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  39.86 
 
 
455 aa  259  5e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  34.73 
 
 
509 aa  259  5e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  37.38 
 
 
516 aa  259  5e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  35.23 
 
 
488 aa  259  5e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  45.2 
 
 
369 aa  259  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  34.96 
 
 
492 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  33.62 
 
 
491 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.44 
 
 
479 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  36.03 
 
 
525 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  41.86 
 
 
391 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  33.05 
 
 
487 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  38.2 
 
 
503 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  38.46 
 
 
511 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  34.73 
 
 
477 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  38.59 
 
 
456 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.11 
 
 
483 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>