133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2397 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  51.89 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  53.36 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  49.52 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  49.06 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  35.55 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  41.78 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  42.25 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  39.42 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  39.69 
 
 		 261 aa  118  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  42.62 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  40.78 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  39.91 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  38.97 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  32.87 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  38.03 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  33.02 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  36.87 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  37.8 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  39.71 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  39.34 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  38.39 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  39.44 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  38.36 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  38.39 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  37.75 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  37.24 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  38.92 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  37.56 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  36.32 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  41.14 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  37.56 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  39.89 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.11 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  38.59 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  36.46 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  32.87 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  35.98 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  36.17 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  30.91 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  35.45 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  31.02 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  30.56 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  29.73 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  32.21 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  30.05 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  26.74 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  28.89 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  31.18 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  31.48 
 
 		 375 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  31.33 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  29.76 
 
 		 520 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  29.76 
 
 		 520 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  28.14 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  29.88 
 
 		 1079 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  29.88 
 
 		 1078 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  27.34 
 
 		 508 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  29.88 
 
 		 1078 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  27.88 
 
 		 521 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  31.71 
 
 		 519 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  27.49 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  28.95 
 
 		 515 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  29.32 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  22.52 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  28.19 
 
 		 991 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  29.51 
 
 		 533 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  28.82 
 
 		 523 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  29.49 
 
 		 504 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  29.49 
 
 		 504 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  31.78 
 
 		 538 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.45 
 
 		 522 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  29.49 
 
 		 504 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  28.85 
 
 		 504 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  28.21 
 
 		 504 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  26.09 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  26.56 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  25 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  26.62 
 
 		 498 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  28.21 
 
 		 504 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  28.3 
 
 		 292 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  23.17 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  32.18 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  28.78 
 
 		 536 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  26.24 
 
 		 277 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  29.41 
 
 		 328 aa  48.5  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  28.99 
 
 		 291 aa  48.5  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  26.62 
 
 		 499 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  27.27 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  25.78 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  30.36 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  25 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  28.95 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  31.97 
 
 		 983 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  23.86 
 
 		 757 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  27.39 
 
 		 314 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  31.15 
 
 		 982 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  24.64 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  23.2 
 
 		 514 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  33.63 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>