More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2708 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  100 
 
 		 514 aa  1043    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  55.41 
 
 		 552 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  69.87 
 
 		 561 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  68.05 
 
 		 492 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  66.78 
 
 		 338 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  33.67 
 
 		 562 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  52.75 
 
 		 613 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  39.58 
 
 		 591 aa  207  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  39.86 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  38.31 
 
 		 526 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  34.54 
 
 		 597 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  50.79 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  51.91 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  29.15 
 
 		 539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  32.08 
 
 		 324 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  26.84 
 
 		 751 aa  123  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  29.66 
 
 		 426 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  29.3 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.08 
 
 		 623 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  29.79 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  28.52 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  30.89 
 
 		 593 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  29.79 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  29.79 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  30.5 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  30.5 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  33.47 
 
 		 762 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  30.5 
 
 		 665 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  27.72 
 
 		 401 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  28.06 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  28.06 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  28.06 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  28.06 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  28.06 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  28.06 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  28.06 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.15 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  28.38 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  27.76 
 
 		 465 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  48.94 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  27.06 
 
 		 504 aa  107  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  43.51 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  48.48 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  27.42 
 
 		 2305 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  39.62 
 
 		 652 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  36.04 
 
 		 997 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  47.57 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 637 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  26.85 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  44.17 
 
 		 507 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  29.58 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  24.59 
 
 		 548 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  41.9 
 
 		 539 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  44.27 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  27.85 
 
 		 1194 aa  94  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  28.21 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  39.64 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  29.18 
 
 		 2310 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  28.43 
 
 		 481 aa  90.9  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  27.88 
 
 		 324 aa  90.1  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  27.88 
 
 		 324 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  25.73 
 
 		 686 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  26.06 
 
 		 897 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  25.73 
 
 		 686 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  25.73 
 
 		 897 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  25.73 
 
 		 897 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  36.17 
 
 		 854 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  27.47 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  41.84 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 773 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  27.38 
 
 		 543 aa  79.7  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  37.62 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.05 
 
 		 984 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  36.73 
 
 		 778 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  29.14 
 
 		 680 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.82 
 
 		 648 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  45.83 
 
 		 614 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 1055 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  22.64 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  51.76 
 
 		 1121 aa  67.4  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  38.54 
 
 		 623 aa  67  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  36.73 
 
 		 688 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.67 
 
 		 809 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  34.02 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  34.13 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  38.14 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  38.54 
 
 		 842 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  35.71 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  31.63 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  45.19 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  33.02 
 
 		 925 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.62 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  33.33 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  35.35 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  36.05 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  36.05 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  42.28 
 
 		 743 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  47.37 
 
 		 608 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  34.41 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>