More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6883 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 821 aa  1657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 		 798 aa  549  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 736 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  36.37 
 
 		 813 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  41.13 
 
 		 739 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 731 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  37.14 
 
 		 807 aa  509  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  36.09 
 
 		 846 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 782 aa  156  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 675 aa  137  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.06 
 
 		 705 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 731 aa  126  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 696 aa  121  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.02 
 
 		 784 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 693 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 774 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.72 
 
 		 713 aa  114  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.02 
 
 		 784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 703 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.76 
 
 		 774 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.34 
 
 		 712 aa  111  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 711 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 782 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  21.63 
 
 		 812 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 687 aa  109  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 704 aa  108  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 710 aa  108  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.1 
 
 		 782 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.53 
 
 		 784 aa  106  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  22.5 
 
 		 777 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 		 824 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 734 aa  100  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  23.32 
 
 		 717 aa  99  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 809 aa  98.6  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 708 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  23.21 
 
 		 690 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 720 aa  95.1  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 791 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 709 aa  94  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  25.05 
 
 		 789 aa  91.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  22.17 
 
 		 774 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  22.69 
 
 		 731 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 795 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  22.17 
 
 		 774 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  22.17 
 
 		 774 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  22.17 
 
 		 774 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 816 aa  88.6  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  22.02 
 
 		 774 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 807 aa  86.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 721 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 809 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 681 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  22.84 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  23.12 
 
 		 809 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 806 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 776 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 777 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 777 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 795 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 721 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 791 aa  77.8  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 777 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 828 aa  77.4  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 801 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 797 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  30.97 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.39 
 
 		 848 aa  74.3  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 798 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 690 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 810 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 678 aa  71.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 769 aa  71.2  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 769 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  21.43 
 
 		 807 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  25.22 
 
 		 727 aa  69.7  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 782 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 785 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 738 aa  68.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 723 aa  68.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  21.82 
 
 		 788 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 726 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  21.89 
 
 		 789 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 786 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  22.35 
 
 		 703 aa  67.4  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  26.87 
 
 		 799 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 689 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 866 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  22.46 
 
 		 693 aa  65.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  22.5 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 836 aa  65.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>