More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2428 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  90.26 
 
 		 363 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  96.37 
 
 		 361 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 360 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  86.29 
 
 		 362 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  81.25 
 
 		 362 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  78.03 
 
 		 362 aa  567  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  79.17 
 
 		 362 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  53.58 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  49.42 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  46.84 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  53.37 
 
 		 376 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  40.06 
 
 		 344 aa  232  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 613 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.46 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 771 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 752 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 406 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 603 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 746 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 1560 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 739 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 3706 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 2693 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 991 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 1093 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 864 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 872 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 462 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 461 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 834 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1654 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 771 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 732 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 709 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 815 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 704 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 721 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 1177 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 215 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 732 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  29.58 
 
 		 624 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  33.91 
 
 		 391 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 572 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 674 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.78 
 
 		 1668 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 807 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 941 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 1239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 1676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 764 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.76 
 
 		 1663 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.18 
 
 		 783 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 526 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 1714 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.95 
 
 		 744 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 437 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 476 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 767 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 932 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1210 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  33.82 
 
 		 754 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1093 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 682 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 774 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 749 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 1253 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>