More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2686 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2686  lipase, class 3  100 
 
 		 617 aa  1231    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.458877  unclonable  0.0000292693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2209  triacylglycerol lipase  63.17 
 
 		 616 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000264431  hitchhiker  0.000196617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2685  triacylglycerol lipase  54.53 
 
 		 562 aa  624  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.871664  unclonable  0.0000237171 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  31.21 
 
 		 622 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  32.97 
 
 		 313 aa  97.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  32.27 
 
 		 313 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.16 
 
 		 1079 aa  87  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  32.24 
 
 		 245 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.66 
 
 		 2667 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.91 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  33.12 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.31 
 
 		 2775 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  32.4 
 
 		 1480 aa  80.5  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.23 
 
 		 820 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.9 
 
 		 1236 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.29 
 
 		 1019 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1424 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.85 
 
 		 946 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  33.1 
 
 		 1164 aa  78.2  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  29.76 
 
 		 1712 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.33 
 
 		 1363 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.15 
 
 		 4334 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  33.47 
 
 		 2954 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.61 
 
 		 3619 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.97 
 
 		 3209 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  34.1 
 
 		 4800 aa  73.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  34.24 
 
 		 1055 aa  73.9  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  32.95 
 
 		 999 aa  73.9  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  31.5 
 
 		 686 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  33.2 
 
 		 3619 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  27.92 
 
 		 1499 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  32.62 
 
 		 2467 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 824 aa  72  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.22 
 
 		 1839 aa  72  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  33.73 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  27.16 
 
 		 1544 aa  70.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 980 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.06 
 
 		 588 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.98 
 
 		 3954 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.38 
 
 		 1156 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.02 
 
 		 3608 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.19 
 
 		 1403 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  34.91 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  30.99 
 
 		 260 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  32.11 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2989  hemolysin-type calcium-binding region  53.52 
 
 		 2469 aa  68.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  31.9 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  28.07 
 
 		 2245 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.98 
 
 		 813 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.34 
 
 		 3427 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  28.69 
 
 		 833 aa  67.8  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  29.15 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  30.69 
 
 		 4723 aa  67.4  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  29.86 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.59 
 
 		 3598 aa  67  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.17 
 
 		 1279 aa  67  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  29.84 
 
 		 4687 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.75 
 
 		 2689 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  26.19 
 
 		 475 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  31.43 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 		 795 aa  67  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.91 
 
 		 4798 aa  67  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  33.16 
 
 		 982 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 		 1895 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  34.5 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 		 1795 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  33.5 
 
 		 2836 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.28 
 
 		 855 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.68 
 
 		 2097 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  34.5 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  33.16 
 
 		 1112 aa  64.7  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.91 
 
 		 1197 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  31.51 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  29.57 
 
 		 757 aa  63.9  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.58 
 
 		 1534 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  33.65 
 
 		 1855 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.37 
 
 		 2107 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  31.32 
 
 		 856 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  34.63 
 
 		 1287 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  38.97 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  34.16 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  32.23 
 
 		 1400 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  31.52 
 
 		 1383 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 9867 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  28.86 
 
 		 515 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  28.99 
 
 		 682 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  33.51 
 
 		 2342 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  33.51 
 
 		 2342 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.05 
 
 		 2911 aa  62.4  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  29.11 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.42 
 
 		 1112 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  41.57 
 
 		 1502 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  29.91 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  31.67 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  38.06 
 
 		 1202 aa  61.6  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  29.29 
 
 		 998 aa  61.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>