88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2685 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2685  triacylglycerol lipase  100 
 
 
562 aa  1120    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.871664  unclonable  0.0000237171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2686  lipase, class 3  54.53 
 
 
617 aa  624  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.458877  unclonable  0.0000292693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2209  triacylglycerol lipase  50.08 
 
 
616 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000264431  hitchhiker  0.000196617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  30.63 
 
 
622 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.71 
 
 
1079 aa  67  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 
467 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.68 
 
 
3209 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.96 
 
 
421 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.58 
 
 
824 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.54 
 
 
833 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  29.71 
 
 
260 aa  58.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.31 
 
 
3608 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.48 
 
 
820 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.58 
 
 
3619 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.15 
 
 
3619 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  31.58 
 
 
2342 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  31.58 
 
 
2342 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.73 
 
 
1180 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  27.04 
 
 
757 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  28.57 
 
 
3587 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  30.05 
 
 
1424 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31.08 
 
 
1019 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  28.46 
 
 
2954 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  26.7 
 
 
3954 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  31.16 
 
 
998 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.25 
 
 
2689 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.29 
 
 
1855 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.45 
 
 
1363 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  26.39 
 
 
856 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  29.91 
 
 
4334 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  28 
 
 
980 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.91 
 
 
946 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.34 
 
 
1073 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.65 
 
 
1839 aa  48.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37.97 
 
 
813 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  24.28 
 
 
959 aa  47.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  32.38 
 
 
1164 aa  47.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  24.47 
 
 
1112 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  41.89 
 
 
1699 aa  47.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  29.07 
 
 
1055 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  24.56 
 
 
2245 aa  47.4  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  25.69 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 
2567 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  27.27 
 
 
1279 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  28.92 
 
 
595 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  25.1 
 
 
1544 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  28.36 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 
982 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  29.35 
 
 
437 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.19 
 
 
2105 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  28.9 
 
 
858 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.47 
 
 
588 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.1 
 
 
1112 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.67 
 
 
1499 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  46 
 
 
2251 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  26.89 
 
 
648 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  31.38 
 
 
1286 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  27.8 
 
 
1480 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.28 
 
 
1197 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  35.78 
 
 
867 aa  45.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.82 
 
 
1236 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  48.98 
 
 
462 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.67 
 
 
1795 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  32.56 
 
 
417 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
8980 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  33.64 
 
 
1156 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.68 
 
 
855 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.96 
 
 
868 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.1 
 
 
202 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 
202 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  25.97 
 
 
313 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  27.49 
 
 
3736 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  29.47 
 
 
795 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  28.51 
 
 
745 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  26.67 
 
 
999 aa  44.3  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  28.22 
 
 
741 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  28.57 
 
 
3587 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  29.35 
 
 
1895 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  32.49 
 
 
1306 aa  43.9  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.63 
 
 
2145 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  27.82 
 
 
2667 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  28.64 
 
 
4800 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 
2885 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  25.98 
 
 
860 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  28.43 
 
 
1534 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  27.3 
 
 
998 aa  43.5  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  27.31 
 
 
537 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>