182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2209 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2686  lipase, class 3  63.17 
 
 		 617 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.458877  unclonable  0.0000292693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2209  triacylglycerol lipase  100 
 
 		 616 aa  1230    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000264431  hitchhiker  0.000196617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2685  triacylglycerol lipase  50.08 
 
 		 562 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.871664  unclonable  0.0000237171 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  30.86 
 
 		 622 aa  216  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.1 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  30.28 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.63 
 
 		 824 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  29.97 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  30.62 
 
 		 820 aa  77.4  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.69 
 
 		 1156 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.37 
 
 		 2245 aa  72  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.61 
 
 		 1363 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.15 
 
 		 1499 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  27.24 
 
 		 833 aa  67.8  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  32.62 
 
 		 946 aa  67  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  35.03 
 
 		 2954 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  26.09 
 
 		 1544 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  28.28 
 
 		 2775 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.99 
 
 		 1079 aa  64.7  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.31 
 
 		 3954 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  27.46 
 
 		 2667 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  28.97 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  29.15 
 
 		 1895 aa  64.7  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.79 
 
 		 4334 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.46 
 
 		 1236 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  32.37 
 
 		 3608 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.67 
 
 		 3619 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.67 
 
 		 3619 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  27.76 
 
 		 2885 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.68 
 
 		 1279 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  30.23 
 
 		 1814 aa  61.6  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.93 
 
 		 1795 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  31.16 
 
 		 795 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  26.79 
 
 		 1855 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.3 
 
 		 855 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  29.41 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  28.63 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31.47 
 
 		 1019 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  28.03 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  29.62 
 
 		 856 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  30.66 
 
 		 1287 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  30.73 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1424 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  36.18 
 
 		 1164 aa  57.4  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  28.14 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  32.1 
 
 		 3598 aa  57.4  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.69 
 
 		 3427 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.17 
 
 		 2467 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.84 
 
 		 2678 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  25.33 
 
 		 813 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.05 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  30.95 
 
 		 1055 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.44 
 
 		 980 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  30.34 
 
 		 341 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  25.66 
 
 		 475 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  29.51 
 
 		 491 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  32.27 
 
 		 460 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  31.44 
 
 		 1112 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.6 
 
 		 4800 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.18 
 
 		 588 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  38 
 
 		 1699 aa  54.3  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.84 
 
 		 556 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.48 
 
 		 1607 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  31.49 
 
 		 2342 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  29.91 
 
 		 341 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  32.46 
 
 		 4214 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  31.49 
 
 		 2342 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.52 
 
 		 3209 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.44 
 
 		 1180 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  26.07 
 
 		 1712 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.6 
 
 		 1534 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  33.67 
 
 		 387 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 		 534 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 467 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  28.41 
 
 		 858 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.1 
 
 		 1112 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  32.16 
 
 		 219 aa  51.2  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  30.73 
 
 		 982 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  26.48 
 
 		 648 aa  51.2  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.64 
 
 		 4798 aa  50.4  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  29.91 
 
 		 1043 aa  50.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.23 
 
 		 2689 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  26.34 
 
 		 1394 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  39.8 
 
 		 411 aa  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  30.05 
 
 		 932 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  33.05 
 
 		 510 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  26.36 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  42.11 
 
 		 6753 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1526 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  29.39 
 
 		 999 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  31.37 
 
 		 1502 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  26.21 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.66 
 
 		 9867 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  34.74 
 
 		 5442 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  32.76 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.31 
 
 		 5962 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  29.17 
 
 		 950 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.23 
 
 		 1197 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>