More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0609 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 328 aa  676    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  57.23 
 
 		 322 aa  358  8e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  51.41 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  39.7 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  41.07 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  35.97 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  41.04 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  41.72 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  39.43 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.59 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  38.57 
 
 		 344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  44.35 
 
 		 304 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  37.03 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  40.55 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  43.07 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  38.36 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  36.77 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  39.57 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  38.82 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  39.84 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  36.88 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  42.37 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  40.96 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  38.91 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  37.59 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  47.52 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.24 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.24 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  40.59 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  42.86 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  37.67 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  41.73 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  40.22 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  35.74 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  38.31 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  43.62 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  35.74 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  37.83 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  36.2 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  36.52 
 
 		 807 aa  163  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  39.33 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  40.44 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  39.15 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3438  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0165681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3520  histone deacetylase superfamily  41.52 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0356949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3588  histone deacetylase superfamily  42.48 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.503962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  35.52 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  40.07 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  40.48 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  39.33 
 
 		 737 aa  156  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  40.44 
 
 		 379 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  39.15 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  36.23 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  40.08 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.63 
 
 		 347 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  35.99 
 
 		 345 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.5 
 
 		 326 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  38.43 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.76 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  37.82 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  39.59 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  35.87 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  37.45 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  36.23 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  39.01 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  35.04 
 
 		 309 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  37.87 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  38 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 321 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  35.04 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  33.44 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  43.9 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  38.19 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  37.94 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  38.19 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  38.58 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  38.55 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  38.58 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  38.58 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.6 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  37.83 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  40.25 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  37.6 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  39.75 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  32.88 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  41.78 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  38.95 
 
 		 369 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  32.11 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  37.41 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  37.71 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  38.12 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  37.04 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>