More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3588 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3588  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.503962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3520  histone deacetylase superfamily  98.46 
 
 		 336 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0356949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3438  histone deacetylase superfamily protein  94.44 
 
 		 324 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0165681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  42.77 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  41.48 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  39.81 
 
 		 344 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  41.3 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  40.37 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.1 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  33.66 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  44.22 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  40.68 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  44.98 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  39.06 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  40.37 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  40.82 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  41.52 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  34.94 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  40.32 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  39.74 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  37.97 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  40.68 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  37.97 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  42.27 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.71 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  41.81 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  36.19 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  38.29 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  40.06 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  39.01 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  43.19 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  37.97 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  38.64 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  46.03 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  38.61 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  34.26 
 
 		 807 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  41.23 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.85 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.96 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  35.96 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  38.87 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  39.79 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  36.39 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.66 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  37.12 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  41.4 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.22 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  37.03 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  37.34 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  37.19 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  37.42 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  40.8 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  39.68 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  40.47 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  35.96 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  36.6 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  36.09 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  38.34 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  37.7 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  38.8 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  40.07 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.13 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  33.13 
 
 		 766 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  36.22 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  33.77 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  38.29 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  39.05 
 
 		 313 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  39.94 
 
 		 307 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  33.76 
 
 		 737 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  35.87 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  35.31 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  38.05 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  37.54 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  37.74 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  38.05 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  36.71 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  37.74 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  36.71 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  37.22 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>