More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24490 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  34.87 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  30.65 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  30.37 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  37.08 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  42.03 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  27.48 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 106 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  42.25 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  36.56 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  36.56 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>