87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0516 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  100 
 
 		 366 aa  738    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  45.92 
 
 		 598 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  47.55 
 
 		 491 aa  265  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  41.87 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.51 
 
 		 343 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.18 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.84 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.5 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.92 
 
 		 355 aa  205  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.92 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.62 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  39.88 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.31 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.35 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.76 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.43 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.08 
 
 		 472 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.44 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  34.71 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  34.73 
 
 		 320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  34.84 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  32.85 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  30.08 
 
 		 400 aa  125  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31 
 
 		 537 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  30.4 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  29.38 
 
 		 456 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.07 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  27.81 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.18 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  29.67 
 
 		 699 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.65 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  29.73 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.2 
 
 		 501 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  27.61 
 
 		 703 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.39 
 
 		 707 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  27.6 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  26.7 
 
 		 1121 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 1121 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  25.18 
 
 		 789 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  29.81 
 
 		 848 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  26.57 
 
 		 804 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 1121 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  23.73 
 
 		 829 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  27.56 
 
 		 581 aa  63.5  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 1112 aa  62.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.39 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.04 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  24.53 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 563 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 1143 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  23.08 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.68 
 
 		 523 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 550 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  24.93 
 
 		 536 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.67 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  27.92 
 
 		 1174 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2822  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  28.4 
 
 		 673 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.05 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.21 
 
 		 562 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25.77 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.08 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  25.83 
 
 		 497 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  23.83 
 
 		 532 aa  46.2  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 		 636 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 		 540 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.23 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 537 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 505 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  24.7 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  37.66 
 
 		 556 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  25.13 
 
 		 679 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 		 581 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  25.81 
 
 		 1186 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  23.51 
 
 		 551 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  23.62 
 
 		 519 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>