209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2392 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 831 aa  1630    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  71.67 
 
 		 748 aa  848    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  40.22 
 
 		 975 aa  315  2.9999999999999996e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  40.84 
 
 		 482 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  31.61 
 
 		 498 aa  207  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  45.49 
 
 		 768 aa  192  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  55.45 
 
 		 600 aa  187  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  29.31 
 
 		 670 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 606 aa  164  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 639 aa  158  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  29.29 
 
 		 674 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  27.79 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 760 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  47.13 
 
 		 703 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  51.09 
 
 		 1004 aa  112  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  45.9 
 
 		 1221 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  58.82 
 
 		 523 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  65.48 
 
 		 524 aa  108  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 451 aa  103  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  33.89 
 
 		 984 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 837 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  63.75 
 
 		 1050 aa  95.1  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  55.95 
 
 		 670 aa  91.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  42.47 
 
 		 651 aa  90.9  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  21.43 
 
 		 457 aa  87.4  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  25.39 
 
 		 457 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  24.04 
 
 		 371 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  23.46 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.9 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.58 
 
 		 1495 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  24.43 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  32.12 
 
 		 1057 aa  76.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  26.52 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.28 
 
 		 623 aa  76.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  24.41 
 
 		 1050 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  23.78 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  23.17 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  24.21 
 
 		 756 aa  73.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  21.78 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  26.54 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  21.76 
 
 		 408 aa  72  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  25.39 
 
 		 383 aa  72  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  40.3 
 
 		 614 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  24.86 
 
 		 1001 aa  71.6  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  25.6 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  24.21 
 
 		 820 aa  70.1  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  24.93 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  22.53 
 
 		 1018 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  23.29 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  23.46 
 
 		 829 aa  68.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  20.91 
 
 		 1014 aa  67.4  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  45.71 
 
 		 617 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  24.59 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  24.5 
 
 		 815 aa  64.7  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  22.09 
 
 		 399 aa  63.9  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  24.08 
 
 		 317 aa  63.9  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  23.87 
 
 		 394 aa  63.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  26.03 
 
 		 690 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  23.63 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  45.54 
 
 		 2170 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  22.53 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  22.08 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  23.92 
 
 		 1041 aa  62.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  23.88 
 
 		 474 aa  62  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  24.53 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.24 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  42.86 
 
 		 743 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.67 
 
 		 998 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  24.2 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  24 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  21.49 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  36.94 
 
 		 1238 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  38.02 
 
 		 1887 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  39.67 
 
 		 703 aa  59.3  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  41.12 
 
 		 1154 aa  58.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.92 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  22.02 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.18 
 
 		 729 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  22.33 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  37.11 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.81 
 
 		 809 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  21.86 
 
 		 1146 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  23.82 
 
 		 376 aa  55.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  20.42 
 
 		 678 aa  55.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  34.58 
 
 		 880 aa  55.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  30.99 
 
 		 910 aa  55.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  21.41 
 
 		 347 aa  55.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  42.27 
 
 		 608 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  21.8 
 
 		 417 aa  55.1  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  25.33 
 
 		 1215 aa  54.3  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  42.22 
 
 		 649 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  32 
 
 		 517 aa  53.9  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.58 
 
 		 674 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  41.67 
 
 		 762 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  23.38 
 
 		 1331 aa  53.5  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  24.42 
 
 		 1780 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  29.71 
 
 		 528 aa  53.5  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>