More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4286 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 540 aa  1088    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  48.72 
 
 		 1755 aa  163  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  45.79 
 
 		 1987 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  29.16 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  45.23 
 
 		 623 aa  143  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.24 
 
 		 506 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  27.38 
 
 		 544 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.41 
 
 		 440 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 		 543 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.79 
 
 		 542 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 510 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.31 
 
 		 637 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.68 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.65 
 
 		 487 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.14 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.72 
 
 		 429 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 		 386 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 458 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 		 386 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  35.98 
 
 		 727 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.84 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.07 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  35.08 
 
 		 1264 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 		 490 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.92 
 
 		 447 aa  97.4  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.13 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.8 
 
 		 428 aa  90.9  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 456 aa  90.5  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.68 
 
 		 294 aa  90.1  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  34.34 
 
 		 362 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 		 193 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 		 417 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  36.93 
 
 		 402 aa  87.4  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  32.45 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  34.38 
 
 		 734 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.62 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  34.19 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.57 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  31.61 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36.22 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  25.41 
 
 		 570 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  31.21 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.14 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  32.96 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.43 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 		 668 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  29.35 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 		 671 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  31.61 
 
 		 239 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  32.75 
 
 		 380 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 648 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  46.24 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  26.98 
 
 		 671 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.95 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.73 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  37.59 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  37.59 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.94 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  34.33 
 
 		 679 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 712 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.94 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  30.82 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.73 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.91 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.91 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  30.06 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  34.15 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  31.71 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.3 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 223 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.73 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 		 638 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.86 
 
 		 185 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  28.75 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.37 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  33.9 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  34.09 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  31.85 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  29.89 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  25.76 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  35.48 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.1 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  31.76 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  30.23 
 
 		 710 aa  73.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  32.81 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 		 585 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 209 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.01 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  33.07 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  26.76 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  27.98 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.497623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>