223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3368 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
596 aa  1213  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  37.12 
 
 
708 aa  315  2e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
626 aa  313  8e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
595 aa  305  2e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
833 aa  305  2e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.02 
 
 
589 aa  303  5e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
833 aa  303  7e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
619 aa  303  8e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 
828 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
598 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
828 aa  293  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
828 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
789 aa  290  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
789 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
754 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
754 aa  287  3e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.79 
 
 
589 aa  285  2e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
693 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
1714 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
732 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  40.06 
 
 
824 aa  278  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 
633 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.51 
 
 
1221 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.87 
 
 
585 aa  271  3e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.15 
 
 
1106 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
968 aa  266  9e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.42 
 
 
529 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 
734 aa  251  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.96 
 
 
699 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 
627 aa  250  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 
1106 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  30.76 
 
 
821 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  30.76 
 
 
776 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  30.76 
 
 
776 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  32.67 
 
 
921 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  30.76 
 
 
776 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
776 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
776 aa  243  8e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  30.58 
 
 
821 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  35.99 
 
 
1415 aa  242  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.67 
 
 
739 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.77 
 
 
667 aa  235  2e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.52 
 
 
715 aa  235  2e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  38.89 
 
 
937 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.1 
 
 
708 aa  234  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
633 aa  234  4e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  29.31 
 
 
797 aa  234  4e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
727 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
1143 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
713 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.2 
 
 
790 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  30.07 
 
 
790 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.45 
 
 
1144 aa  226  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.56 
 
 
740 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 
781 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
822 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
717 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
717 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
733 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.78 
 
 
739 aa  217  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
780 aa  215  1e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  29.02 
 
 
780 aa  215  1e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.68 
 
 
739 aa  215  2e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  35.18 
 
 
1116 aa  214  3e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  31.38 
 
 
552 aa  213  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
718 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
796 aa  209  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
647 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
750 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
4489 aa  204  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 
723 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
647 aa  204  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
3560 aa  201  2e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
3035 aa  201  4e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.65 
 
 
742 aa  199  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.3 
 
 
816 aa  196  8e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
779 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
909 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
1085 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
667 aa  191  3e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
616 aa  191  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  31.32 
 
 
553 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
974 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
1094 aa  188  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
793 aa  186  1e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
739 aa  184  4e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
761 aa  183  8e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 
654 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  29.54 
 
 
560 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 
632 aa  176  1e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
732 aa  176  2e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
660 aa  175  2e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
618 aa  173  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  31.87 
 
 
632 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
569 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
700 aa  169  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 
740 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 
724 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
574 aa  167  6e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
611 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>