126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02159 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02159  adhesin  100 
 
 		 1250 aa  2510    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  98.62 
 
 		 1234 aa  2438    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  98.56 
 
 		 1250 aa  2471    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  95.05 
 
 		 1252 aa  2334    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  98.14 
 
 		 1234 aa  2425    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  82.14 
 
 		 1254 aa  2026    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  95.06 
 
 		 1234 aa  2282    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  30.43 
 
 		 1806 aa  231  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  30.1 
 
 		 1327 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  30.49 
 
 		 1594 aa  222  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  30.1 
 
 		 466 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  29.61 
 
 		 2637 aa  212  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  28.84 
 
 		 773 aa  208  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 1579 aa  204  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  29.53 
 
 		 1327 aa  193  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1165 aa  193  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1165 aa  193  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  29.38 
 
 		 1349 aa  191  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  29.38 
 
 		 1327 aa  192  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 		 4312 aa  191  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  28.48 
 
 		 4391 aa  190  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  27.91 
 
 		 3322 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.89 
 
 		 2057 aa  185  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  28.96 
 
 		 989 aa  177  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  25.49 
 
 		 1102 aa  163  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.27 
 
 		 868 aa  160  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  30 
 
 		 955 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  31.65 
 
 		 338 aa  150  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  29.71 
 
 		 955 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 		 950 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  31.32 
 
 		 306 aa  140  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  32.79 
 
 		 1626 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.89 
 
 		 806 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.44 
 
 		 1234 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  28.77 
 
 		 1108 aa  127  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.96 
 
 		 1277 aa  121  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 		 1113 aa  118  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  26.71 
 
 		 1012 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  27.26 
 
 		 3415 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  26.83 
 
 		 3420 aa  111  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.76 
 
 		 2926 aa  105  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 995 aa  105  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.71 
 
 		 1268 aa  98.6  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  26.78 
 
 		 1254 aa  97.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.5 
 
 		 1099 aa  97.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29 
 
 		 1086 aa  95.5  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  26.53 
 
 		 1259 aa  95.1  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27.08 
 
 		 1269 aa  95.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  26.52 
 
 		 2906 aa  94.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  26.92 
 
 		 1259 aa  94.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  26.17 
 
 		 1285 aa  94.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.71 
 
 		 818 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  26.51 
 
 		 1571 aa  93.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  25.92 
 
 		 2578 aa  94  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 		 819 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  25.92 
 
 		 1861 aa  91.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 		 825 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  24.38 
 
 		 997 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  22.99 
 
 		 1004 aa  87.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  32.65 
 
 		 861 aa  83.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.2 
 
 		 1023 aa  83.2  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  23.62 
 
 		 1028 aa  82.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.41 
 
 		 1093 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.41 
 
 		 1093 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.3 
 
 		 1748 aa  78.2  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.3 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  25.78 
 
 		 773 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.28 
 
 		 1067 aa  73.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  23.63 
 
 		 733 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  26.25 
 
 		 1593 aa  70.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  24.77 
 
 		 769 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  24.87 
 
 		 731 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  38.28 
 
 		 1068 aa  69.7  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  24.32 
 
 		 729 aa  69.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  25.79 
 
 		 1040 aa  67.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.44 
 
 		 1753 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.99 
 
 		 1770 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  25.17 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  25.82 
 
 		 1762 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  25.82 
 
 		 1762 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.65 
 
 		 1763 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.62 
 
 		 1770 aa  63.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.38 
 
 		 1741 aa  61.6  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 1144 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.24 
 
 		 1122 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.28 
 
 		 1070 aa  58.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  24.76 
 
 		 638 aa  56.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  22.93 
 
 		 1008 aa  56.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  24.76 
 
 		 638 aa  56.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.06 
 
 		 1070 aa  56.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  34.67 
 
 		 1049 aa  54.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 		 909 aa  54.3  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.13 
 
 		 638 aa  54.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  26.46 
 
 		 2642 aa  54.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  23.36 
 
 		 732 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  34.29 
 
 		 506 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  34.29 
 
 		 506 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  27.91 
 
 		 483 aa  51.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  29.03 
 
 		 994 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  23.15 
 
 		 765 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>