143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1687 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1687  integrase family protein  100 
 
 		 355 aa  733    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  42.42 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0620  hypothetical protein  40.3 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0137294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1491  integrase family protein  40.17 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  31.13 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2734  integrase family protein  29.06 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000151395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  27.81 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  27.58 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  31.19 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.26 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.56 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  26.34 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.44 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  26.13 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  29.68 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  33.56 
 
 		 400 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  29.8 
 
 		 172 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.89 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.83 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  24.73 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  23.05 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  30.34 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  34.26 
 
 		 463 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.4 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  21.72 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  28.73 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  27.95 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  25.7 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  22.46 
 
 		 337 aa  49.7  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 322 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  25.94 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  25.73 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  28.22 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  24.84 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.82 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  26.37 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  31.33 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  29.2 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.61 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  27.51 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.76 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  27.71 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  27.65 
 
 		 476 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  30.48 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  25.61 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  27.1 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  29.69 
 
 		 407 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  23.91 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  26.87 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  25.41 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  30.15 
 
 		 159 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.47 
 
 		 357 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.31 
 
 		 379 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  37.84 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  25.49 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  27.92 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  25.73 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  24.91 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.47 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  24.78 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  24.78 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.98 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  24.78 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.28 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  25.27 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.27 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.27 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.03 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.82 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  23.44 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  30.66 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  23.44 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  24.19 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  28.25 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  28.82 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.8 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.67 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  25.27 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  28.31 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  28.86 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  32.99 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.98 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.88 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>